Проблемы и перспективы молекулярной генетики. Том 1 - Свердлов Е.Д.
ISBN 5-02-002753-7
Скачать (прямая ссылка):
0,7
0,9
1,3
1,3
0,9
1,3
0,9
1,8
1
9
15,8
0,8
0,8
0,8
5,8
4,2
21
13
9,5
14
3,5
3,5
20
14
3,5
3,5
12
1,5
1,5
4,5
4
1,5
5,7
9,3
1,7
0,5
0,3
0,9
4,7
3,:
0,Я
0,8
0,8
5,7
0,7
2,1 2,1
3,6
2,5
0,5
1,5
2,5
2,5
2,5
0,6
31
4,1
Таблица 9 (окончание)
Этнос Популяция Числен- ность Номер аллеля (число тандемных повторов)
26 27 28 29 30 31 32 33
Русские Курск (Курский р-он) 81 0,6
Курск (Октябрьский р-он) 70 2 1
Курск (Понырёвский р-он) 73 0,6
Архангельск (Ошевенск) 78
Архангельск (Холмогоры) 49
Новгород (Болот) 114 0,4 0,4
Новгород (Ларфино) 88 1,1 0,6 0,6
Москва 50
Кострома 53 1
Рязань 47
Белорусы Хойники 64 0,9
Несвиж 41
Гродно 66
Бобруйск 95 0,5
Пинск 71 0,7
Украинцы Алчевск 56 0,9 0,У
Львов 68 1 1,3
Киев 71
Молдоване Кишинев 50
Башкиры Белорецкий р-н 60
Архангельский р-н 50 1
Абзелиловский р-н 66
Стрелибашевский р-н 48 1 1
Илишевский р-н 59 1
Коми Сыктыквар 69
Татары Ельбуга 45 1 1 1
Удмурты Воткинск 46 2 1
Ижевск 52 2
М. Пурга 64
Мордва с. Алова 74 1 1
с. Подгорная 68 1,5
Мари с. Каркатово 100 1,5
Чуваши Чебоксары 49 2 1
Адыги Шасуги 289 1,4 0,2 0,2
Майкоп 59 0,8 0,8 0,8
Ханты с. Русскинское 70 3 0,7 0,7 0,7
Калмыки г. Элиста 100 0,5 0.5 0,5
Коряки Камчатский п-ов 81 0,6
Якуты с. 1 юнгюлю 85 1 0,6
СЕРН Среднеевропейская выборка, сформированная Центром по изучению полиморфизма человека (Париж, Франция)
342
3. Во многих локусах мутации имеют большую тенденцию увеличивать длину тандемного повтора, реже уменьшать.
Что касается минисателлитных локусов, то для ряда из них, а именно тех, которые наиболее активно используются в популяционных и идентификационных исследованиях (АроВ, D1S80, D17S30 и др.), были обнаружены сходные закономерности в мутационных событиях, как и в случае микросателлитов. Среднее значение скорости мутаций составляло 0,5р 10~3 (с доверительным интервалом 0,1-0,9 х 10~3), что практически совпадает с таковым для тетрануклеотидных микросателлитов - 0,6 х 10~3 (интервал 0,2-1,0 х 10~3) (Sajantila et al., 1999). У минисателлитов также наиболее часто возникают мутации с изменением длины участка на небольшое число повторяющихся единиц (от 1 до 7), независимо от того, каков размер повторяющейся единицы в локусе. Анализ мутационных событий в минисателлитных локусах показывает, что основным механизмом также является проскальзывание цепи во время репликации, и только в редких случаях (теоретически) можно допустить неравный кроссинговер. Рассмотрим популяционногенетические свойства мультиаллельных микросателлитных локусов на примере триплетного повтора в гене миотонинпротеинкиназы (хромосома 19). Этот повтор находится в некодирующей области гена и известен тем, что его значительная экспансия (удлинение) является причиной наследственной неврологической болезни, называемой миотонической дистрофией (Tishkoff et al., 1998). В норме число триплетных повторов данного локуса варьирует от 5 до 30 и несколько более. При миотонической дистрофии, как было рассмотрено ранее, число повторов достигает сотен и тысяч, образуя гигантские по размеру микросателлитные участки на хромосоме. По названию этой болезни данный триплетный локус часто обозначают как ло-кус DM.
Однако, несмотря на такую тесную связь с наследственной патологией, микросателлитный локус в норме ведет себя как нейтральный маркер и имеет характеристики, делающие его пригодным для популяционных исследований. В различных популяциях количество аллельных вариантов достигает 20. На рис. 117 представлено в качестве примера распределение аллелей данного локуса для трех популяций.
Видно, что у русских наиболее часто встречается пятич генный повтор (так называемый мажорный аллель), его частота встречаемости в популяциях славян достигает 40, а иногда 50% (табл. 9). Значимыми аллелями является группа аллелей с числом повторов от 11 до 14, причем соотношения частот внутри этой группы варьируют в различных популяциях. В отдельных случаях частота 13-членного повтора достигает более высоких значений (> 20%). Интересно, что между пятичленным повтором и 11-членным имеется значительное “разрежение” частот - в этой области (с 6-го по 10-членный повтор) встречаемость аллелей крайне низкая, в некоторых популяциях они вообще отсутствуют. Связано ли это явление с его какими-то стери-ческими особенностями данного участка ДНК, или же с влиянием на функционирование гена - остается не ясным. Однако видно, что эта область находится под неким влиянием сильного отрицательного давления. Следующее “разрежение” начинается с 15-членного повтора и доходит до 19-член-ного. В области аллелей 20-22 можно уловить третью волну (очень слабую по значимости) и затем размытую область более длинных аллельных вари-
