Проблемы и перспективы молекулярной генетики. Том 1 - Свердлов Е.Д.
ISBN 5-02-002753-7
Скачать (прямая ссылка):
Таким образом, полиморфизм мультиаллельных локусов довольно высок, отсюда следует, что и их информативность также должна быть весьма значительной.
Ранее показано, что основным механизмом, ведущим к образованию новых аллельных вариантов мини- и микросателлитов, является неравный крос-синговер, хотя рассматривались также и другие механизмы, в частности -репликативного проскальзывания. Однако в последнее время появились данные, указывающие на то, что рекомбинационные события не являются основной причиной образования новых аллелей мини- и микросателлитов.
Многочисленными исследованиями было показано, что скорость мутаций в микросателлитных районах, находящихся на аутосомах, составляет величину 2 х 1СЬ3 (Sajantila et al., 1999). Приблизительно такая же величина (2,8 х 1СН) была определена и для микросателлитных локусов, находящихся в нерекомбинирующем районе Y-хромосомы (Kayser et al., 2000). Равенство величин скорости мутаций для микросателлитов аутосом и Y-хромосомы косвенно указывает на то, что рекомбинации не являются причинами мутаций этих последовательностей, т.е. образования новых аллельных вариантов, отличающихся по длине - по количеству элементарных звеньев. В то же время само строение микросателлитов позволяет предполагать склонность таких участков к неравному кроссинговеру. Но коль скоро неравный кроссинговер на них не происходит, можно считать, что здесь имеются механизмы, его запрещающие.
Детальный анализ мутационных событий в микросателлитных локусах показал, что чаще всего происходит добавление или выпадение участка, равного одному элементарному звену (одношаговое изменение). При этом увеличение длины микросателлита происходит примерно в 2,5 раза чаще, чем уменьшение. Отсюда следует, что со временем должна наблюдаться тенденция образования все более длинных аллельных вариантов в локусе. Таким образом, более короткие аллели могут рассматриваться как более древние по сравнению с длинными. Действительно, если сравнивать приматов и человека, то аллельные варианты тех же локусов оказываются у приматов более короткими. Однако необходимо отметить, что тенденция удлинения аллелей наблюдается не для всех локусов - некоторые имеют мутации, как удлиняющие, так и укорачивающие аллельные варианты. Также отмечено, что скорость мутаций увеличивается у более длинных микросателлитов, а также у тех, которые имеют сложное строение, т.е. содержат в своем составе более одного типа повторяющегося звена.
Таким образом, можно подчеркнуть следующие свойства микросателлитных локусов.
1. Происходящие в них мутационные изменения связаны, по-видимому, с механизмом проскальзывания при репликации.
2. Мутационные события происходят чаще всего одношагово - путем добавления или потери одного элементарного звена.
339
Таблица 9. Распределение частот аллелей локуса DM в различных популяциях
Этнос Популяция Числен- ность Номер аллеля (число тандемных повторов)
5 6 7 8 9 Ш 11 12
Русские Курск (Курский р-он) 81 47,5 0,6 4 15,4
Курск (Октябрьский р-он) 70 40 I I 1 12 13
Курск (Понырёвский р-он) 73 38,3 0,6 14,4 12,3
Архангельск (Ошевенск) /й 41,7 1,3 11,5 9
Архангельск (Холмогоры) 49 31,8 1 18,4 12,2
Новгород (Волот) 114 32 0,4 21,5 12
Новгород (Парфино) 88 37 13,7 13,7
Москва 50 50 5 15
Кострома эЗ 42 1 14 8
Рязань 4? 40 1 15 11
Белорусы Хойники С4 43,9 0,9 1 9 11
Несвиж 41 42 21 12
Г родно 66 33 10,5 14
Бобруйск 95 35 0,5 1 14 9
Пинск 71 48 1,4 7 14,1
у краишп,1 Алчевск 56 28 1,8 1,» 13 19
Львов 68 36 I 16 21
Киев 71 38 1 15 13
Молдоване Кишинев 50 44 1 1 12 II
Башкиры Бечорецкнй р н 60 32,5 1,7 12,5 9,2
Архангельский р-н 50 27 1 6 15
Абзелиловский р-н 66 28 12 16
Сгрелибашевский р-н 48 28 16 22
Илишевский р-н 59 28 I 2 12 14
Коми Сыктыквар 69 31 1 14 11
Татары Елабуга Г" 45 33 11,5 13
Удмурты Воткинск 46 28 13 19
Ижевск 52 45 6 1
М. Пурга 64 38 10 18
I Мордва с. Алова 74 31 1 10 16,5
с. Подгорная 68 22 I 21 9,5
| Мари с. Каркатово 100 34 0,5 3,5 16 18
Чуваши Чебоксары 4У 40 1 8 14
Адыги Шасуги 289 37 0,2 0,7 0,2 0,2 15,6 10,4
Майкоп 59 35 1,7 3,4 12 19
Хаиты с. Русскинское 70 25,7 1,4 21, 13 21,4
Калмыки г. Элиста 100 14,5 0,5 10 28,5
Коряки Камчатский п-ов 81 23 2,5 2,3 9 25 25
Якуты с. Тюнгюлю 85 7 0,6 14,7
1 СЕРН Среднеевропейская выборка, сформированная Центром по изучению полиморфизма человека (Париж, Франция) 42 1 1 12 13
340
13
14,8
14
19
22,4
21,4
17,5
17
11
17
24
16
13
21
24
14,1
22,3
13
16
14
14,2
16
24
17
20
23
19
18
13
10
16,5
18
17,5
28
13,7
14
16,4
30
J_
39
13
Номер аллеля (число тандемных повторов)
14
7,4
15
4,3
16
0,6
17
18
0,6
19
20
1,2
21
0,6
22
1
0,6
0,6
0,6
3,4
8,3
1,3
0,6
1,3
1,3
1,3
8,2
10,1
0,4
0,4
0,4
1,3
0,4
10
0,6
1,7
0,6
1,1
1,7
12
и,9
1,6
0,9
10,5
1,5
1,5
И
1,5
6,3
2,8
0,7
1,4
2,8
