Биотехнология. Том 17 - Янулайтис А.А.
Скачать (прямая ссылка):
EcoR II (Mph I) CCWOO CviNY I CC
Sau 96 I GGNCC Fok I CATCC
ScrF I (Sso II) ccngg Hae III GGCC
Stu I (Aat I) AGGCCT Kpn I GGTACC
War I GGCGCC
Sfi I GGCCN5GGCC
а—см. пункт «а» примечаний к табл. 12. б — в скобках приведены названия изошнзомеров аналогично реагирующих на dcm метилирование.
Таблица 17
Чувствительность рестриктаз к dam метилированию
Рестриктазы, чувствительные к Рестриктазы, не чувствительные
к dam метилированию к dam метилированию
Название фермента Специфичность2 Название фермента Специфичность3
(изошизомеры (изошизомеры)®
Bel I (AtuC I, TGATCA BamH I (BamF I, GGATCC
BspX II, BstG I, ВатК I, Bst I)
Cpe I) Bgl II (Ncr I) AGATCT
Cla I (Ban III, АТС GAT BspM II (Mro I) TCCGGA
BspX I) Pvu I (Rsh I, CGATCG
Hph 1 GGTGA Xor I)
Mbo I (BstE II, GATC Sau3A I (FnuE I, GATC
CviA I, Dpn II, Pfa I, Dpn I*,
Mme II, Nde II) Cfu I*, Nan II*,
Mbo II (Ncu I) GAAGA NmuD I*, NmuE I*)
Nru I (Ama I) TCGCGA Spo I TCGCGA
Taq I (Tfl I, TCGA Xho I (BstYI) RGATCY
TthHB I)
Xba I TCTAGA
Acc III TCCGGA
Bin I (Alw I) GGATC
Bsph I TCATGA
Mfl I RGATCY
а — см. пункт «а» примечаний к табл. 12. б — в скобках приведены названия нзошизомеров, аналогично реагирующих на dam метилирование.
* — расщепляет только при наличии ш6 в обеих цепях узнаваемой последовательности.
4.4.7. Чувствительность метилаз к модификациям субстрата
Чувствительностью к сайт-специфическому метилированию отличаются не только рестриктазы, но и другие белки, взаимодействующие с ДНК [357, 387]. Метилазы не являются в этом отношении исключением. Сайт-специфические модификации типа т5С, т6А, т4С и hm5C (5-гидроксиметилцитозин) в неканонических положениях иногда ингибирует действие некоторых метилаз. Сводные данные представлены в табл. 18.
Таблица 18
Чувствительность метилаз к модификациям субстрата
Метилаза (специфичность)3 He блокируется предвари Блокируется предвари
тельной модификацией тельной модификацией
MAlu I (AGm5CT) AGm4CT
МВашН I (GGATm4CC) GGm6ATCC GGATCm5C
MBst I (GGATmCC) GGm6ATCC
MCfr6 I (CAGm4CTG) CAGm5CTG
MCla I (ATCGm6AT) m6ATCGAT
ATm5CGAT
MCviB III (TCGm6A) Tm5CGA
MEcoR I (GAm6AITC) GAATTm5C Gm6AATTC
MEcoR II (Cm5CWGG) Cm4CWGG
MEco dam (Gm6ATC) GATnl5C
GAThm5C
GATm4C
MFok IA (GGm6ATG) CATCm5C CATm5CC
MHha I (Gm5CGC) GCGm5C
MHha II (Gm6ANTC) GANTm5C
МНра II (C^CGC) m5CCGG
MHph I (Tm5CACC) GGTGm6A
MMbo I (Gm6ATC) GATm5C
MMbo II (GAAGm6A) Tm5CTTm5C
MMsp I (m5CCGG) Cm5CGG
MMva I (Cm4CWGG) Cm5CWGG
MPvu II (CAGm4CTG) CAGm5CTG
MEcoT2 dam (Gm6ATY) GAThm5C
MEcoT4 dam (Gm6ATC) GAThm5C
MTaq I (TCGm6A) Tm5CGA
а — см пункт «а» примечаний к табл. 12., б — см. пункт «б» примечаний к табл. 13.
Интересно отметить, что имеется пример отсутствия ингиби-ции реакции метилирования даже в случае действия на субстрат метилаз, узнающих одинаковые последовательности нуклеотидов, и модифицирующих одно и то же основание в разных метах. Речь идет о MEcoR II и MMva I, которые узнают последовательность 5'CC(A/T)GG и модифицируют цитозин, расположенный рядом с осью симметрии, образуя ш5С и ш4С соответ-
