Биотехнология. Том 17 - Янулайтис А.А.
Скачать (прямая ссылка):
в составе узна! леотидов, узнаваем ы полужирным шри фтом.
з CG или CNG, м< лированию CG и Таблица 15
естриктазы, выделен частично перекрыв: CNG, находящихся
твительные к мети 1ЮЩИХСЯ с ним3
1аемого участка или
m5CG входит в сайт т5СО может частич m5CNG входит m5CNG может час
узнавания® но перекрываться в сайт узнавания® тично перекрываться
с узнаваемым с узнаваемым
сайтом® сайтом®
1 2 3 4
Асс П (CGCG) Ара I (GGGCCC) Bbv I (GCNGC) AIu I (AGCT)
Aha II (GRCGYC) Asp718 I BspM II Ара I (GGGCCC)
Aos II (GRCGYC) (GGTACC) (TCCGGA) Asp718 I
Ava I (CYCGRG) Ava II (GGWCC) BsuF I (CCGG) (GGTACC)
Вер I (CGCG) Bme216 I BsuQ I (CCGG) Ava II (GGWCC)
Bsp Mil (GGWCC) Cfl6 I (CAGGTG) BamI-1 I
(TCCGGA) BspM I CfrlO I (GGATCC)
BssH II (ACCTGC) (RCCGGY) Bgl II (AGATCT)
(GCGCC) EcoR I (GAATTC) Csp I Bme216 I
BstU I (CGCG) Hga I (GACGC) (CGGWCCG) (GGNCC)
BsuE I (CGCG) Nhe I (GCTAGC) Eag I (CGGCCG) BspM I
BsuM I Sau3A I (GATC) EcoR II (ACCTGC)
(CTCGAG) Sau96 I (GGNCC) (CCWGG) Bst I (GGATCC)
Fnu4 I (GCNGC) BsuR I (GGCC)
59
5CG входит в сайт СО может частич m5CNG входит CNO может час
узнавания** но перекрываться в сайт узнаванияб тично перекрыться
с узнаваемым с узнаваемым
сайтом® сайтом®
1 2 3 4
Sfi I Нар II (CCGG)
(GGCCNGGCC)
Hpa II (CCGG)
Mph I (CCWGG)
Msp I (CCGG)
Nae I (GCCGGS)
Nci I (CCWGG)
Not I
(GCGGCCGC)
Pst I (CTGCAG)
Pvu II
(CAGCTG)
Rsr II
(CGGWCCG)
Sac II
(CCGCGG)
ScrF I (CCNGG)
Sma I (CCGGG)
Sso II (CCNGG)
Xma III
(CGGCCG)
Cfrl3 I (GGNCC)
Dra II RGGCCY)
EcoR I (GAATTC)
Hae III (GGCC)
Hga I (GACGC) Mfl I (RGATCY)
Ngo II (GGCC)
Nhe I (GCTAGC) Sau 36 I (GATC)
Sau96 I (GGNCC)
Sfi I
(GGCCN5GGCC> Sin I (GCWCC) Xho II (RGATCY) Хог II (CGATCG)
BsuR II (CTCGAG)
Cfo I (GCGC)
Cla I (ATCGAT)
Csp I (CGGWCCG)
Eaq I (CGGCCG)
Eco47 III (AGCGCT)
FnuD II (CGCG)
Fsp -I (TGCGCA)
Hae II (RGCGY)
Hap II (CCGG)
Hha I (GCGC)
HinP I (GCGC)
Hpa II (CCGG)
Мае II (ACGT)
Mlu I
(ACGCGT)
Nae I
(GCCGGC)
Nar I
(GGCGCC)
Ngo I
RGCGCY)
Not I
(GCGGCGC)
Pvu I (CGATCG)
Rsr II
(CGGWCCG)
Sal I (GTCGAC)
Sma I (CCCGGG)
Tha I (CGCG)
Xho I (CTCGAG)
Хог II (CGATCG)
a — см. пункт «а» примечаний к табл. 12. б — в скобках приведена последовательность нуклеотидов, узнаваемая данной рестриктазой. Цитозины, входящие в состав CG или CNG, метилирование которых препятствует действию данной рестриктазы, выделены полужирным шрифтом.
В настоящее время для ряда рестриктаз, участки узнавания которых полностью или частично перекрываются с dcm и dam сайтами, определено влияние обсуждаемого метилирования на их способность расщеплять субстрат. Эти данные представлены в табл. 16 и 17.
Чувствительность рестриктаз к dcm метилированию
Рестриктазы, чувствительные к Рестриктазы, не чувствительные
dcm метилированию к dcm метилированию
Название фермента Специфичность3 Название фермента Специфичность3
(изошизомеры)® (изошизомер ы)^
Ava II (Bme216 I, GGWCC BamH I (Bst I) GGATCC
Есо47 I) Afl I GGWCC
Ара I GGGCCC Bgl I GCCN5GGCT
Asp718 I GGTACC BstE II GGTNACC
Dra II RGGNCCY BstN I (Aac I, CCWGG
(ЕсоОЮЭ I) Ару I, BspN I,
Eae I YGGCCR Mva I, TaqX I)
