Биотехнология. Том 17 - Янулайтис А.А.
Скачать (прямая ссылка):
SacI I CCGCGG ? m5CCGCGG
Sail GTCGAC ? GTm5CGAC
GTCGm6AC*
SalDI TCGCGA TCGCGm6A ?
Sau3AI GATC6 Gm6ATC GATm5C6
GATm4C
GAThm5C
Sau96I GGNCC ? GGNm5CC
GGNCm5C
GGNhm5Chm5C
Sbol3J TCGCGA TCGCGm6A ?
ScrFI CCNGG m5CCNGG C-^CNGG
SfaNI GATGC GATGm5G Gm6ATGC
Sfil GGCCN5GGCC GCm5CCN5GGm5CC6 GGCCN5GGCm4:
Sfll CTGCAG p CTGCm6AG
SinI GGWCC ? GGWm5CC
Smal CCCGGG Cm5CCGGG ffl4CCCGGG
m5CCCGGG6
Cm4CCGGG6
CCm4CGGG
CCm5CGGG6
Spel ACTAGT ? m6ACTAGT
Sph'I GCATGC GCATGm5C p
Ghm5CATGhm5C
SplI CGTACG CGTmeACG ?
Spol TCGCGA TCGCGm6A ?
SsoII CCNGG ? Cm5CNGG
m5CCNGG
Sso47I GAATTC ? Gm6AATTC*
Рестриктаза Узнаваемая Расщепляемые Нерасщепляемые
последовательность последовательности последовательности
SstI GAGCTC ? AGGm5CCr
? AGGCm5CT6
Stul AGGCCT Tm5CGA6 TCGm6A*
TaqI TCGA Thm5CGA6 GAGhm5CThm5C
TaqI I GACCGA p G"«ACCGA
CACCCA
TaqXI CCWGG m5CCWGG ?
Cm5CWGG
Tfll TCGA ? TCGm6A
Thai CGCG ? m5CGCG
hm5CGhm5CG
TthHBI TCGA Tm5CGA TCGm6A*
Xbal TCTAGA ? TCTAGm6A*
Tm5CTAGA
Thm5CTAGA
Xhol CTCGAG6 ? CTCGAG
CTCGmeAG
“«CTCGAG
XhoII RGATCY RGm6ATCY RGATm5CY6
Xmal CCCGGG CCm5CGGG6 m4CCCGGG
m5CCCGGG
Cra4CCGGG
CCm4CGGG
Xmalll CGGCCG ? CGGm5CCG
XmnI' GAAN4TTC GAm6AN4TTC Gm8AAN4TTC
GAAN4TTm5C6
Xorl] CGATCG CGm6ATCG CGATm5CG
hm5CGAThra5CG
Примечания:
а. # — метилирование, осуществляемое штаммо-специфической метнлазой (каноническое метилирование). М=А или С; K=G или Т; N=A, С, G, или Т; R=A или G; Y = C или Т; W=A или Т; S=G или С; D=A, G, или Т; Н=А, С или Т. Последовательности приведены в 5'-»-3' направлении. т4С= = Ы4-метилцитозин; ш5С = С5-метилцитозин; 1,т5С=гидроксиметилцитозии; п,6А=Ы6-метиладенин; шС=неопределена природа метилированного цитозина. Номенклатура ферментов согласно [115, 353].
б). AccI медленно расщепляет неметилированную цепь в гемиметилироваи-ной последовательности GTMKAm5C. Aha II (GRCGYC) последовательность GRCGCC расщепляет эффективнее при наличии метилирования: GRCGm5CC [258], ио не расщепляет последовательности GRCGYm6C [258, 274]. Asp718I расщепляет ДНК вируса NY2A хлореллы, модифицированную метилазой CviQI (GTm6AC). Asp718I не расщепляет последовательностей, перекрывающихся с участком, узнаваемым ост метилазой GGTACm6CWGG [268], а также ш5С-за>мещеиную ДНК фага ХР12, в то время как Kpnl расщепляет эту ДНК [258], Aval медленно расщепляет неметилированную цепь в гемиметилиро-ванной последовательности CTCGm6AG/CTCGAG [258]. Ball в 50 раз медленнее расщепляет последовательности, перекрывающиеся с участками модифицированными dcm метилазой (TGGCra5CAGG) по сравнению с неметилиро-ваииыми, BanI с различной скоростью расщепляет узнаваемую последовательность в различных позициях которой включен ш5С [211, 287J. Bgll с раз-
