Научная литература
booksshare.net -> Добавить материал -> Биология -> Янулайтис А.А. -> "Биотехнология. Том 17" -> 20

Биотехнология. Том 17 - Янулайтис А.А.

Янулайтис А.А. Биотехнология. Том 17 — Москва, 1989. — 204 c.
Скачать (прямая ссылка): fermentiserekteciiiihpremenenie1989.djvu
Предыдущая << 1 .. 14 15 16 17 18 19 < 20 > 21 22 23 24 25 26 .. 107 >> Следующая

ляющиеся субстратом для рестриктаз Mse I [267] и TspE I [319], и 3 гексануклеотида — 5'-ТТТААА, 5'-ААТАТТ, 5'-АТТААТ, являющиеся субстратом для рестриктаз — прототипов Aha III [391], Ssp I [319] и Vsp I [17] соответственно.
Третий тип симметричных последовательностей представляет собой октануклеотидный палиндром. Известна только одна рестриктаза (Not I), обладающая свойством узнавать такой субстрат [319].
Узнаваемые последовательности некоторых рестриктаз включают в себя нечетное число нуклеотидов (5 или 7 нуклеотидных пар). За исключением центрального нуклеотида, взаимное расположение остальных оснований в таких участках удовлетворяют требованиям вращательной симметрии второго порядка. Эти последовательности в табл. 8 представлены 4— 6 типами. Их можно рассматривать как «разорванные» тетра-или гексануклеотидные палиндромы, симметричные части которых разделены одной нуклеотидной парой. Появление в центральной части палиндромных последовательностей одной нуклеотидной пары не меняет число теоретически возможных вариантов пента- и гептануклеотидных последовательностей, по сравнению с тетра- и гексануклеотидными. Как видно из данных, представленных в табл. 8, до настоящего времени в качестве участков узнаваемых рестриктазами идентифицированы всего 6 таких пентануклетодиных и 1 гептануклеотидная
Палиндромные чгетра- и гексануклеотидные последовательности и рестриктазы, узнающие их
п/п XYY’X’ NXYY’X’N AXYY’X’T CXYY’X’G QXYY’X’C TXYY’X’A
прототип число прототип число прототип число прототип число прототип число
изошизоме- изошизоме- ИЗОШИ- И30ШИ- ИЗОШИ-
ров ров зомеров зомеров зомеров
1. ААТТ TspEI 1 Hind III 20 Mfe I 1 EcoR I 8 SnaB I 4
2. ACGT Мае И 1 Ssp I 1 PmaC I 4 Aat 11 1 BspH I 2
3. AGCT Alu I 5 Mlu I 3 Pvu II 7 Sac I 7 BspM II 7
4. АТАТ Nla III 3 Spe I 1 Nde I 1 EcoR V 10 Nru I 5
5. CATG Hpa II 17 Bgl II 2 Nco I 2 Sph I 4 Xba I' 1
6. CCGG FnuD II 23 Eco47 III 2 Sma I 6 Nae I 25 Bel I 11
7. CGCG Mae I 2 Stu I 7 Sac II 50 BseP I 8 Mst I 12
8. CTAG Mbo I 76 Sea I 3 Avr II 1 Nhe I 1 Bal I 2
9. GATC Hha I 12 Cla I 13 Pvu I 15 ВашН I 30 Asu II 15
Ю. GCGC Hae III 52 Ava III 3 Xma III 4 Nar I 10 Aha III 2
11. GGCC Rsa I 3 Vsp I 3 Spl I 2 Ара I 3
12. GTAC Taq I 4 Xho I 37 Kpn I 21
13. ТАГА Mse I 1 Pst I 57 Sna I 2
14. TCGA Afl II 2 Sal I 10
15. TGCA ApaL I 5
16. ТТАА Hpa I 2
Всего: 13 200 11 58 14 189 16 147 10 61
Примечание: Для краткости в таблице приводится только одиа цепь двухиитевой ДНК. Слева 5'-конец. справа— d . литературным источником сведений, приведенных в таблице, служит список Робертса Г3191, дополненный ‘ не вошедшими в него данными [1, 24, 33, 41, 44, 47, 48, 52, 319]
последовательности (из 32 и 128 теоретически возможных соответственно) .
Довольно необычный тип разорванных палиндромных последовательностей (табл. 8, типы 7—8) характерен для участков узнаваемых Gsu I: 5'-CTGGAG [188] и Fsf I: 5'-CTGAAG [319]. Эти гексануклеотиды можно рассматривать как палин-дромный тетрануклеотид 5'-CTAG, разделенный двумя расположенными в центральной части основаниями фиксированной природы GG/CC или GA/TC.
Другой вариант разорванных пента- и гептануклеотидных палиндромов представляют последовательности, характеризующиеся менее строгим порядком построения (табл. 8, типы 9 и
11). В центре этих последовательностей допускается присутствие любой нуклеотидной пары, как А/Т, так и С/G. Поэтому субстратом для каждой рестриктазы этой группы является не одна, а две последовательности, различающиеся средней парой нуклеотидов. Как видно из данных, представленных в табл. 8, всего известно 62 рестриктазы, узнающие 6 из 16 возможных пентануклеотидов и 29 ферментов, субстратом для которых является 3 различных гептануклеотида обсуждаемого типа.
Разнообразие разорванных палиндромных последовательностей узнаваемых рестриктазами, не ограничивается вышеуказанными вариантами. Недавно обнаружены эндонуклеазы Nla IV [300] и Sec I [107], узнаваемые последовательности которых можно характеризовать как тетрануклеотидные палиндромы, разделенные двумя любыми основаниями: 5'-GG(N)2CC и 5'-CC(N)2GG (табл. 8, тип 10). Открыты также рестриктазы, узнающие разорванные гексануклеотидные палиндромы (табл. 8, типы 12—16). Как видно, число любых нуклеотидов, разделяющих симметричные части узнаваемой последовательности, варьирует от 3 до 9. Однако, их число в каждом конкретном случае является строго фиксированным, т. е. рестриктазы не узнают последовательностей палиндромные части которых разделены меньшим или большим числом несимметричных оснований. К настоящему времени известно 22 фермента, узнающие 11 различающихся по структуре уникальной части разорванных гексануклеотидов.
Предыдущая << 1 .. 14 15 16 17 18 19 < 20 > 21 22 23 24 25 26 .. 107 >> Следующая

Реклама

c1c0fc952cf0704ad12d6af2ad3bf47e03017fed

Есть, чем поделиться? Отправьте
материал
нам
Авторские права © 2009 BooksShare.
Все права защищены.
Rambler's Top100

c1c0fc952cf0704ad12d6af2ad3bf47e03017fed