Биотехнология. Том 17 - Янулайтис А.А.
Скачать (прямая ссылка):
16 GPuGCPyC HgiJ II 22
22. XPyYY'PuX' 1 CPyCGPuG Ava I 15
23. PuXYY'X'Py 16 4 PuCCGGPy CfrlO I 2
PuGCGCPy Нае II 4
PuCATGPy Nsp I 2
PuGATCPy Xho II 5
24. PyXYY'X'Pu 16 2 PyACGTPu BsaA I I
PyGGCCPu Cfr I 10
25. PyXYY'X'G 16 1 PyGGCCG Gdi I I
26. XY (A/С) (G/T)Y'X' 16 1 GT (A/C) - Acc I 1
(G/T)AC Sty I 8
27. XY(A/T) (A/T)Y'X' 16 1 CC(A/T) -
(A/T) GG NspB II 1
28. X(A/C)YY'(G/T)X' 16 1 С (A/С) GC-
(G/T)G HgiA I
29. X(A/T) YY' (A/T) X' 16 1 G(A/T) GC^ 3
(A/T) С Нае I 1
30. (A/T)XYY'X'(A/T) 16 1 (A/T)GGCC-
(A/T)
31. X(G/A/T) YY'- 16 1 G(G/A/D- Sdu I 4
(C/A/T)X' GC(C/A/T)C
Ir. P азорванны e---в Ы p 0 ж Д ¦иные последовательности-
32. PuXY (A/T) Y'X'Py 16 1 PuGG(A/r)- PpuM I 2
CCPy
33. PuXYNY'X'Py 16 1 PuGGNCC- Dra II 4
Py
Продолжение таблицы 8
№
п/п
Тнп
построения
о) m : а. о с о я с
S
0.0.
«а то S 0
'О
о х
о 2 и ч ж о ё * Р
Прототипы
в (- « я
О О « 2 н О s <« а> s S С ЧЛЯ8
н о
U « 4* S в Я
25
о 2 а
я 3 а> sp ® S
II. Несимметрические последовательности
34. ХХХХ 120 1 ССТС Min I 1
35. ХХХХХ 480 10 ACGGC BceF I 1
GGATC Bin I 3
GTCTC BsmA I 2
АСГСС Bsr I 1
GTGCC Fin 1 1
GGATG Fok I 2
GACGC Hga I 1
GGTGA Hph’ I 2
GAAGA Mbo II 3
GCATC SfaN I 1
36. ХХХРиХХ 480 2 ТССРиАС Мше I 1
СААРиСА Tthlll II 1
37. ХХХХХХ 2016 9 GAAGAC Bbv II 1
GAATGC Bsm I 1
ACCTGC BspM I 1
GAACCA Drd II 1
TCCGCC Eci I 1
GGrCTC Eco31 I 29
GAGACG Esp3 I 1
СТСТТС Ksp632 I 2
GACCGAl Taq II 1
CACCCAJ 1
1106
Всего:
143
Примечания: Для краткости в таблице приводится только одна цепь двухнитевой ДНК. Слева 5'-конец, справа—3'. X и Y-нуклеотиды определенной природы. X и X'; Y и Y' и т. д.— комплементарные нуклеотиды; N— любой нуклеотид; Ру, Ри — пиримидиновые и пуриновые нуклеотиды. Указание нуклеотидов в скобках означает, что любой из них может занять указанное положение в последовательности.
Литературным источником сведений, приведенных в таблице, служит список Робертса [319], дополненный не вошедшими в него данными [1 16, 24, 33, 41, 44, 47, 48, 52, 189].
жение и в том, что значительно расширился список типов участков, узнаваемых рестриктазами, который сейчас равняется 37 (см. табл. 8).
Больше половины (655) известных рестриктаз узнают короткие тетра- и гексануклеотидные последовательности, которым характерна вращательная симметрия второго порядка, т. е.
они являются палиндромами (обращенными повторами). Од--нако среди всех идентифицированных вариантов построения узнаваемых участков истинные палиндромы представлены только первыми тремя типами (табл. 8). Теоретически может существовать 16 различающихся по своему составу тетрануклео-тидных, 64 гексануклеотидных и 256 октануклеотидных палиндромов. Возможные варианты построения симметричных тетра- и гексануклеотидных палиндромов, в том числе все, уже выявленные в качестве участков узнаваемых рестриктазами, приведены в табл. 9. Как видно из представленных данных обнаружено 200 рестриктаз (т. е. 18% от всех охарактеризованных), узнающих 13 различных тетрануклеотидных последовательностей. Число известных ферментов, узнающих гекса-нуклеотидные палиндромы, равняется 455, т. е. составляет больше 40% от всех охарактеризованных в этом отношении рестриктаз. Субстратом этих ферментов является 51 из 64-х теоретически возможных симметричных гексануклеотидов. Среди обнаруженных палиндромов преобладают последовательности, богатые CG нуклеотидными парами. Долгое время вопрос о возможности обнаружения рестриктаз, узнаваемые участки которых состоят только из А и Т оснований, оставался открытым. Однако, в последнее время в качестве участков, узнаваемых рестриктазами уже реализованы 5 таких последовательностей: 2 тетрануклеотида — 5'-ТТАА и 5'-ААТТ, яв-
