Проблемы и перспективы молекулярной генетики. Том 1 - Свердлов Е.Д.
ISBN 5-02-002753-7
Скачать (прямая ссылка):
Fuller M. Genetic control of cell proliferation and differetiation in Drosophila spermatogenesis I I Sem. Cell Develop. Biol. 1998. Vol. 9. P. 433-444.
Glover C.V.C. On the physiological role of casein kinase II in Saccharomyces cerevisiae // Progr.
Nucl. Acid Res. Mol. Biol. 1998. Vol. 59. P. 95-133.
Guerra B. et al. Protein kinase CK2: evidence for a protein kinase CK2(3 subunit fraction, devoid of the catalytic CK2a subunit, in mouse brain and testicles // FEBS Lett. 1999. Vol. 462. P. 353-357.
Hiller M.A. et al., Developmental regulation of transcription by a tissue-specific TAF homolog // Genes Develop. 2001. Vol. 15. P. 1021-1030.
Kalmykova AJ. et al. Acquisition and amplification of a testis expressed autosomal gene, SSL, by the Drosophila Y chromosome // Proc. Nat. Acad. Sci. USA. 1997a. Vol. 94. P. 6297-6302. Kalmykova AJ. et al. The Su(Ste) repeat in the Y chromosome and (3CK2tes gene encode predicted isoforms of regulatory (3-subunit oi protein kinase CK2 in Drosophila melanogaster // FEBS Lett. 1997b. Vol. 416. P. 164-166.
Kalmykova AJ. et al. CK2(3tes gene encodes a testis-specific isoform of the regulatory subunit of casein kinase 2 in Drosophila melanogaster // Europ. J. Biochem. 2002. Vol. 269. P. 1418-1427.
Kramer J. et al. Differentiation: the selective potentiation of chromatin domains //Development.
1998. Vol. 125. P. 4749^1755.
Kuhn R. et al. A cluster of four selectively expressed genes in the male germ line of Drosophila melanogaster // Mech. Develop. 1991. Vol. 35. P. 143-151.
Michiels F. et al. A 14 bp promoter element directs the testis specificity of the Drosophila (32 tubulin gene // EMBO J. 1989. Vol. 8. P. 1559-1565.
Padmanabla R., Glover C.V.C. Casein kinase II of yeast contains two distinct a polypeptides and an unusually large (3 subunit //J. Biol. Chem.. 1987. Vol. 262. P. 1829-1835.
Salghetti S.E. et al. Regulation of transcriptional activation domain function by ubiquitin // Science. 2001. Vol. 293. P. 1651-1653.
Saxena A. et al. Isolation and sequencing of cDNA clones encoding a and P subunits of Drosophila melanogaster casein kinase II // Mol. and Cell. Biol. 1987. Vol. 7. P. 3409-3417. Schlatt S. et al. Germ cell transfer into rat, bovine, monkey and human testes // Human Reprod.
1999. Vol. 14. P. 144-150.
Su Y. et al. The human growth hormone gene cluster locus control region supports position-independent pituitary- and placenta-specific expression in the transgenic mouse // J. Biol. Chem.
2000. Vol. 275. P. 7902-7909.
Sugano S. et al. Protein kinase CK2 interacts with and phosphorylates the Arabidopsis circadian clock-associated I protein//Proc. Nat. Acad. Sci. USA. 1998. Vol. 95. P. 11020-11025.
White-Cooper H. et al. Transcription of meiotic cell cycle and terminal differetiation genes depends on a conserved chromatin associated protein, whose nuclear localisation is regulated // Development. 2000. Vol. 127. P. 5463—5473.
Xu X. et al. Globozoospermia in mice lacking the casein kinase II a.' catalytic subunit // Nat. Genet.
1999. Vol. 1. P. 118-121.
Yamaguchi У. et al. Casein kinase II interacts with the bZIP domains of several transcription factors // Nucl. Acids Res., 1998. Vol. 26. P. 3854-3861.
Yuan X. et al. Duplicated proteasome subunit genes in Drosophila melanogaster encoding testes-specific isoforms // Genetics. 1996. Vol. 144. P. 147-157.
ФУНКЦИОНАЛЬНАЯ ОРГАНИЗАЦИЯ ГЕНОМА ДРОЗОФИЛЫ:
ГЕНЕТИЧЕСКИЕ ЭЛЕМЕНТЫ В ПРОТЯЖЕННОМ РАЙОНЕ ЭУХРОМАТИНА
В.Е. Алаторцев
Сектор генных взаимодействий Отдела молекулярной генетики клетки
Сиквенирование и компьютерный анализ генома Drosophila melanogaster позволили получить ряд важных результатов, касающихся структурной организации генома, и перейти к более детальному анализу особенностей его структурно-функциональной организации. Мы исследуем район Х-хромосомы длиной 200 т.п.н.. Охарактеризован ряд новых генов и составлена детальная карта транскрипции данного района. Значительную часть всех генов составляют дуплицированные гены. Как правило, гены расположены очень компактно, с минимальными межгенными расстояниями. Организация экспрессии многих соседних генов характеризуется образованием тандемных и перекрывающихся транскриптов. По-видимому, эухроматическая часть генома дрозофилы сильно неоднородна по плотности генов и содержит протяженные районы с максимально компактным расположением генов, подобные исследуемому нами району. Обсуждается роль обнаруженных в исследуемом районе кластеров повторов динуклеотидов GT и повторов сателлитной ДНК в регуляциии активности генов района и компактизации хроматина.
Структура генома Drosophila melanogaster была определена в 2000 г. (Adams et al., 2000). Для предсказания генов в геномном сиквенсе дрозофилы были использованы компьютерные программы, а также данные по гомологии с сиквенироваными кДНК дрозофилы и известными доменами белков (Adams et al., 2000). Было выявлено 13 600 генов дрозофилы. Примерно 3000 генов - имеют гомологиии с генами, найденными также у нематоды С. ele-gans и дрожжей S. cerevisiae. Значительное число предсказанных генов оказалось совершенно новыми, с неизвестными функциями. Возможно, кодируемые такими генами белки участвуют в каких-то специфических для дрозофилы процессах. Однако, учитывая ошибки при компьютерном предсказании генов в геномной ДНК дрозофилы, необходимо выполнить большой объем экспериментальной работы по проверке существования in vivo пред-
