Проблема белка. Том 3: структурная организация белка - Попов Е.М.
ISBN 5-02-001911-9
Скачать (прямая ссылка):
Исходными в решении обратной задачи являются, с одной стороны, мшнокислотная последовательность гормона и, следовательно, его информационные возможности, а с другой - спектр биологического йствия гормона и количественные оценки активности каждой функции, осле определения минимально необходимого набора синтетических галогов для каждого из них также обязательны столь же исчер-Ывающие биологические испытания. В работе [384] авторы опирались на Меющийся в литературе экспериментальный материал. Хотя для AT II он шболее обширен, тем не менее и здесь ощущается недостаток опытных актов, касающихся биологических испытаний синтетических аналогов, оследние, как правило, протестированы лишь по одной функции, а »этому остаются неизвестными очень важные полные спектры их юлогических активностей. Наличие таких данных позволило бы зна-1тельно расширить результаты исследования и углубить их понима-ie.
Относительная энергия низкоэнергетических конформаций природных ангиотензинов (АТ I-АТ II) и синтетических аналогов AT II
Группа Номер Шейп Относительная энергия
конфор конфор конформации (Uo6llI, ккал/моль)
AT II [Asn1]- AT III ATI AT II-
АТН (1-6)-
пеп-
тид
А 1 fe--- ef 0 4,4 7,4 0,8 2,6
2 ff --- -flf --- --- ef 0,9 0 1,2 0 1
3 ff --- --- ее 3,5 3,4 5,1 7,9 | 2,8
4 fe- -ее 4,0 8,5 7,3 3,0 2,6
В 1 ff- --- ее 3,5 5,3 4,1 9,9 3,6
2 ee --- ее 3,7 2,5 9,6 0
3 fe fee --- ее 4,4 2,6 1,8 - 0,8
4 ee- -ef 4,6 2,7 1 7,5 0
5 fe- --- ef 6,0 3,2 о 8,3 0,8
6 ef- --- ее 7,0 8,0 4,1 - 5,6
С 1 ff-efe-ee 7,5 - 9,5 - 5,8
D 1 fe-fff-ef 7,8 9,8 5,3 5,4 2,7
Е 1 fe-eee-ee 7,8 - 9,0 - 5,6
F 1 fe-eff-ef 8,0 4,8 4,0 7,6 5,1
Решение обратной структурной задачи для AT II строится на основе известного из работы [378] набора предпочтительных по энергии конформаций природной молекулы. Расчет показал, что структурная организация октапептидного гормона может быть представлена ограниченным числом низкоэнергетических и легко переходящих друг в друга конформаций, которые в зависимости от геометрии центрального тетрапептидного фрагмента Val3-His6 распадаются на две группы (см. табл. IV.26). В одной из них (А) основная цепь тетрапептидного участка имеет структуру типа fef. а в другой (В) - типа fee В каждой группе конформации отличаются друг от друга состояниями N- и С-концевых дипептидов и в свою очередь могут быть разделены на структуры со свободной боковой цепью остатка Asp, или Arg. В интервал 0-8,0 ккал/моль входят четыре конформации группы А, в т ом числе наиболее выгодная по энергии (UQбщ- 0 ккал/моль), и
[Рго3]- [Рго5]- [Ala3] [Ala5] [Рго2]- [Ala8] [Leu8]- [Val8]- flle8]- пУ]-
-АТИ ---ATI1 -АТП -АТ 11 -АТ11 -АТП -АТII -АТII -АТИ -АТII
0 0 0 0 - 0 0 0 1,3 0
- 0 0,6 0,9 - 1,3 2,0 2,3 4,0 0
- 8,8 2,7 4,6 - 4,7 1,5 4,9 0 3,8
4,5 1,8 3,5 4,8 - 3,4 0,3 5,0 0,2 3,6
- 6,4 4,3 4,9 - 6,2 4,6 5,4 1,3 3,0
- 6,5 5,8 7,4 4,6 6,5 5,7 7,4 5,1 3,8
- - 3,8 5,5 - 5,7 2,8 6,2 3,7 5,5
- - 5,8 7,4 9,5 6,5 6,3 4,9 7,9 6,2
- - 5,4 7,0 - 5,8 4,9 2,8 6,0 8,9
- 6,5 7,5 7,4 0 9,3 6,1 5,7 5,4 7,7
- - 10,0 7,5 - 7,6 4,1 3,7 4,2 7,1
- - 8,8 9,0 - 8,0 9,1 2,6 - 7,0
- 7,4 7,3 7,7 - 8,2 4,5 3,8 4,0 7,3
- - 7,9 7,8 0,8 8,0 8,9 5,5 5,0 7,6
шесть конформаций группы В, самая предпочтительная из которых обладает энергией 3,5 ккал/моль. В высокоэнергетическую часть этого интервала (7,5-8,0 ккал/моль), кроме того, попали еще четыре конформации, имеющие на центральном участке Val3-His6 отличные от А и В шейпы основной цепи еее и eff).
В организмах млекопитающих AT II встречается в двух разновидностях, различающихся аминокислотным остатком в первом положении, но одинаковых по биологической активности. Из табл. IV.26 видно, что по конформационным возможностям [Авп^-аналог схож с нативным гормоном. Следует отметить лишь смену глобальной конформации в группе А. В молекуле [Asp']-AT II наименьшую энергию имеет конформация Аь В ее стабилизацию существенный вклад вносит остаток Arg2, гидрофобная часть боковой цепи которого осуществляет эффективные дисперсионные
