Научная литература
booksshare.net -> Добавить материал -> Биология -> Попов Е.М. -> "Проблема белка. Том 3: структурная организация белка" -> 145

Проблема белка. Том 3: структурная организация белка - Попов Е.М.

Попов Е.М. Проблема белка. Том 3: структурная организация белка — М.: Наука, 1997. — 604 c.
ISBN 5-02-001911-9
Скачать (прямая ссылка): problemabelkat31997.djvu
Предыдущая << 1 .. 139 140 141 142 143 144 < 145 > 146 147 148 149 150 151 .. 303 >> Следующая

10.2. АПАМИН
Апамин, оказывающий сильное токсическое действие на центральную нервную систему, был впервые выделен в 1965 г. Е. Хэберманном и К. Рейцем из яда пчелы [74, 75]. Его химическое строение установлено Р. Чиполини и соавт. [76]. Оказалось, что молекула апамина представляет собой октадекапептид, включающий четыре остатка цистеина, которые образуют два дисульфидных мостика Cys'-Cys11 и Cys3-Cys15 (рис. III. 10). Спонтанное реокисление полностью восстановленного пептида при pH 8,5 и температуре 25°С происходит достаточно быстро (хотя и не с 100%-ным выходом) и приводит к полной реставрации его нативной конформации
Рис. ШЛО. Аминокислотная последовательность апамина
Первые исследования зависимости между структурой апамина и его функцией проведены Дж. Винсентом и соавт. [77] и К. Гранье и соавт. [78]. Изучение различных физико-химических свойств апамина указывает на то, что молекула имеет жесткую бициклическую структуру [79-83]. Она сохраняется практически неизменной в широкой области значений pH, мало подвержена влиянию природы растворителя и химической модификации боковых цепей ряда функциональных остатков [79]. В работах К. Гранье и соавт. [78] и А.И. Мирошникова и соавт. [79] показано, что для проявления нейротоксичности апамина критическими являются два остатка (Arg13 и Arg ). Синтетический апамин по своей биологической активности, структуре и другим свойствам, как и следовало ожидать, полностью идентичен природному [84].
Теоретический конформационный анализ ab initio апамина, проведенный ПН. Мельниковым и автором данной монографии [85-89], был разбит на четыре этапа, в каждом из которых использовались результаты предшествующего. В свою очередь, этапы делились на целый ряд последовательно решаемых стадий (рис. III. 11). Первый этап включает рассмотрение конформационных возможностей ундекапептидного участка Cys1 -Cys11, чему предшествовало решение конформационных задач для ДИ-, три-, тетра- и т.д. пептидных фрагментов. Полученные здесь результаты и независимое исследование пентапептидного участка Cys1 -Cys15 послужили на завершающей стадии второго этапа основой для конфор-И*Ционного анализа пентадекапептидного фрагмента апамина Cys'-Cys 5. Третий этап состоял из расчета С-концевого тетрапептида Cys15-His18 ®Вачала в его свободном состоянии, а затем во взаимодействии с конфор-
Рис. III. 11. Схема конформационного анализа молекулы апамина
мациями пентадекапептидного участка Cys’-Cys15, полученными на втором этапе. Наконец, четвертый этап заключался в уточнении структуры апамина путем повторного рассмотрения конформационных состояний боковых цепей остатков в потенциальном поле всей молекулы. Кратко остановимся на наиболее интересных моментах каждого этапа. В табл. III. 11 представлены величины относительной энергии ?/общ предпочтительных конформаций ундекапептидного участка Cys’-Cys11, полученные на основе детального рассмотрения пространственного строения большого числа составляющих его фрагментов (рис. III. 11). Глобальная структура (иобщ = 0) четко делится на два различных по своим конформа-ционным свойствам участка: Cys'-Thr8 и Ala9-Cysn. Первый образует в значительной степени автономную от остальной части фрагмента Cys'-Cys11 конформационно жесткую нуклеацию, которая стабилизирована эффективными взаимодействиями между входящими в нее остатками Рассмотрев возможное пространственное строение линейного ундекапептидного фрагмента апамина, авторы работ [76-80] подошли к наиболее интересному этапу исследования - оценке стерической предрасположенности рассчитанных конформаций к образованию дисульфидной связи. В
Относительная энергия линейных и циклических конформаций фрагмента Cys'-Cys11 апамина
Шейп Конформация tV,,,,, ккал/моль
Линейный ундекапептид
feffefeefe f - В^,- R|- K\221 - В5- R6 - В\,, - Bf, - R9 - В$ - в!,1* 0
j R2-B23-R2-R2222 -R -Взи-Вз|-В - L32 - Bj 2,0
I R2 --- В23“ R3“ R2222 --- ® “ R ®31 --- ^ --- ^32---^3 3,6
feffefeffe R2 --- В2^“ R2---R2222 --- ® К ---В^]] ---В^| ---L ---R^2--- В2 2,0
МФ!е R3~ R13“ R3~ 1*2222 -Вз2-В2 0,5
Meffeee Ri~R13-R3-R2222 "В -R -Изц-Вц-В -В32-В3 3,3
eeefeffeee В^ --- ®13 --- В2 --- R3222 ~ ^ --- R “ ^ 311 ®22 ® В2 7,4
Циклический ундекапептид
feffefeefe (^22 --- ®23~ ^3--- ^2222 --- ® ---R ---B-^jj---B-^j---R --- В-^-В12 0
< R22-В23-R2-R2222~В -R -Взп-В3|-В -Ьз2-В31 5,5
[R22-B23-R2-R2222_B ~R _B311~B31_R -R32-L33 7,4
Предыдущая << 1 .. 139 140 141 142 143 144 < 145 > 146 147 148 149 150 151 .. 303 >> Следующая

Реклама

c1c0fc952cf0704ad12d6af2ad3bf47e03017fed

Есть, чем поделиться? Отправьте
материал
нам
Авторские права © 2009 BooksShare.
Все права защищены.
Rambler's Top100

c1c0fc952cf0704ad12d6af2ad3bf47e03017fed