Научная литература
booksshare.net -> Добавить материал -> Биология -> Попов Е.М. -> "Проблема белка. Том 2: Пространственное строения белка" -> 36

Проблема белка. Том 2: Пространственное строения белка - Попов Е.М.

Попов Е.М. Проблема белка. Том 2: Пространственное строения белка — М.: Наука, 1996. — 480 c.
ISBN 5-02-001697-7
Скачать (прямая ссылка): problemabelkat21996.djvu
Предыдущая << 1 .. 30 31 32 33 34 35 < 36 > 37 38 39 40 41 42 .. 232 >> Следующая

Дж. Браун и соавт. [316] предложили гипотетический механизм сборки антиген-специфичного межклеточного комплекса HLA класса
75
Р и с. 1.13. Ленточная схема трехмерной структуры а,3-гетеродимера HLA—DR1 класса II (а) и области контактов субъединиц димера (б) [316]
76
Р и с. 1.14. Гипотетический механизм сборки антиген-специфичного клеточного комплекса HLA класса II, Т-клеточного рецептора и корецептора CD4 [316]
П, TCR и корецептора CD4 (рис. 1.14). Предполагается, что на первых порах а, (3-домены Т-клеточного рецептора и его ассоциированные CD3 и ^-субъединицы образуют слабые димеры, подобные димерам DR1, которые до появления комплекса DR1-TCR не являются стабильными. Комплекс становится необратимым, как только молекулы DR1 связываются со специфическим пептидом посредством TCR. Окончательная стабилизация комплекса создает условия для возникновения эффективных взаимодействий четырехдоменного корецептора CD4 одновременно с обоими мономерами TCR и белками МНС II (рис. 1.12, 6). Ассоциация CD4 означает включение сигнальной системы для запуска иммунного клеточного ответа.
Структура комплекса HLA-DRl-пептид. Антигены главного комплекса гистосовместимости (МНС или у человека HLA) являются трансмембранными гликопротеинами. Они связывают пептиды внутри клетки, в цитоплазматическом пространстве, и доставляют их во внеклеточное пространство, где они становятся доступны Т-клеткам, участвующим в механизме функционирования иммунной системы, идентификации чужеродного антигена и для ответа на его появление [320, 321]. Взаимодействие Т-клеточного рецептора антигена с ассоциированным на МНС (HLA) пептидом стимулирует в Т-клетке экспрессию белков главного центра гистосовместимости. Индивидуальный организм имеет небольшой набор разновидностей таких белков. Между тем факты свидетельствуют о том, что каждый из них обладает способностью связывать огромное количество патогенных пептидов и сигнализировать о необходимости ответных действий. Кажущееся противоречие разрешается благодаря широкому полиморфизму молекул белков МНС, т.е. лабильности их трехмерных структур или, иными словами, возможности принимать отдельными, преимущественно поверхностными, участками белковой глобулы большое число самых разнообразных конформацион-ных состояний.
Белки МНС класса I и класса II имеют различные организации Доменов при сходном характере пространственных структур. Молекулы обоих классов обладают двумя, сближенными с мембраной, иммуноглобулиноподобными доменами и удаленным от мембраны пептидсвя-зывающим центром, образованным (3-структурой из восьми тяжей и двумя а-спиральными областями [316,317]. Полиморфизм форми-
77
Рис. 1.15. Ленточная схема трехмерной структуры пептидсвязывающего центра HLA— DR1 класса И
Рис. 1.16. Схема водородных связей между пептидом и пептидсвязывающим центром комплекса HLA—DR1/HA
рующих связывающие центры аминокислотных остатков белков класса I и класса II обусловливает их легкую адаптируемость к пептидам различных последовательностей. Однако это не исключает специфичности взаимодействий. Белки МНС-I, как правило, ассоциируются с пептидами небольшой длины, обычно в 10 остатков, и отличаются
78
высокой избирательностью к природе аминокислот в определенных местах олигопептидной последовательности при толерантности к природе всех других участков цепи [322-324]. Белки МНС класса I функционируют в эндоплазматическом ретикулуме, где параллельно идет интенсивный процесс генерирующего пептиды протеолиза. Белки МНС класса II действуют в эндосомальных и липосомальных компартментах, в которых также одновременно идет протеолиз. Обычно представители этого класса связывают более длинные пептиды и также демонстрируют высокую чувствительность к локализации в последовательности различных аминокислот [325-328].
Результаты рентгеноструктурного анализа внеклеточных частей нескольких белков HLA-I человека [329-332] и МНС-I мыши [333, 334] свидетельствуют о наличии общего механизма пептидного связывания белками класса I. В структурах всех исследовании пептид-белковых комплексов пептиды имели сходные конформации, стабилизированные в центрах связывания в принципе одной и той же системой водородных связей и специфическими дисперсионными взаимодействиями боковых цепей нескольких остатков ассоциированного пептида с комплементарными им гидрофобными карманам! белковой глобулы [332-338].
О связывании пептидов с белками МНС (HLA.) класса II можно судить по результатам рентгеноструктурного исследования JI. Штерна и соавт. [338] пространственного строения комшекса внеклеточной части белка HLA-DR1 с пептидом вируса гриппа НА 306-318 триде-капептидным фрагментом гемагглютинина, мембранного гликопротеина этого вируса. Дифракционная картина получена сг одного кристалла при -170°, используя синхронное излучение с \ = (1,910 А. Трехмерная структура комплекса HLA-DR1/HA идентифицирована с разрешением 2,75 А. Ее ленточная диаграмма представлена на рис. 1.15. Тридека-пептид НА сорбирован в связывающем центре HIA-DR1 в вытянутой, закрученной с большим шагом форме. Она представляет наилучшие возможности для взаимодействий, с одной стороны, с окружающими пептид аминокислотными остатками, а с другой - с поверхностными остатками Т-клеточного рецептора. Таким образом, пептид открыт для межклеточных взаимодействий. Схема реализуемых в комплексе HLA-DR1/HA 12 водородных связей показана на рис. L16. Связи осуществляются только между атомами основной цепи пептида НА и атомами консервативных аминокислотных остатков а-спиральных и (3-струк-турных областей HLA-DR1. Следовательно, система водородных связей не зависит от конкретной последовательности пептида, т.е. является универсальной для пептидных комплексов HLA-DR1 класса II. Этот факт свидетельствует также о близких ориентациях пептидов в комплексах одновременно относительно связывающих центров белков HLA-DR1 и TCR, принадлежащих двум клеткам.
Предыдущая << 1 .. 30 31 32 33 34 35 < 36 > 37 38 39 40 41 42 .. 232 >> Следующая

Реклама

c1c0fc952cf0704ad12d6af2ad3bf47e03017fed

Есть, чем поделиться? Отправьте
материал
нам
Авторские права © 2009 BooksShare.
Все права защищены.
Rambler's Top100

c1c0fc952cf0704ad12d6af2ad3bf47e03017fed