Научная литература
booksshare.net -> Добавить материал -> Биология -> Попов Е.М. -> "Проблема белка. Том 2: Пространственное строения белка" -> 192

Проблема белка. Том 2: Пространственное строения белка - Попов Е.М.

Попов Е.М. Проблема белка. Том 2: Пространственное строения белка — М.: Наука, 1996. — 480 c.
ISBN 5-02-001697-7
Скачать (прямая ссылка): problemabelkat21996.djvu
Предыдущая << 1 .. 186 187 188 189 190 191 < 192 > 193 194 195 196 197 198 .. 232 >> Следующая

В работе Фершта и соавт. [138] экспериментально изучены и
401
детально рассмотрены термодинамические и кинетические данные о денатурации барназы и десятков ее мутантов (в основном единичных). На этой основе были рассчитаны параметры <pxs для переходного состояния и сделаны заключения о структурных изменениях белковой цепи барназы, происшедшие при ее развертывании на участке N TS. Они рассматриваются нами после короткого обсуждения аналогичного материала, полученного для промежуточного состояния (I) на стадии свертывания цепи D I [139]. Изменения свободной энергии состояния I при мутации рассчитывались из констант скорости развертывания (kD) и свертывания (k_D):
AAG,_n = -RTlQ[(k"20/k50)/(k'DH2° / k'?°],
. н2о . н2о . ,н2о . ,н,о где kD , kD и kD 2 kD 1 — константы скорости развертывания! и
свертывания белковой цепи соответственно дикого типа и мутанта в воде. Анализ действия мутантов на промежуточное состояние опирается на параметр фь значения которого при свертывании цепи рассчитываются по формуле
ф] = 1 - (AAG|_n /AAGd_n).
В табл. III.6 приведены итоговые результаты всей работы Ферщта и сотрудников, посвященной изучению пути свертывания белка с привлечением большого числа мутантов [110, 113, 137—141]. Исключены лишь данные о нескольких параллельных мутациях, не содержащих существенной дополнительной информации. Представленные в табл. III.6 значения ф] и фх5 составляют основу, по существу единственную, на которую могут опираться авторы в своих выводах о последовательности конформационных изменений белковой цепи при ренатурации. Согласно приведенным данным, из 33 исследованных мутантов у четырех в промежуточном состоянии и у семи в переходном значения ф! и фТ5 попадают в интервал 0,8—1,0, что указывает на реализацию у остатков в местах мутации конформаций, наблюдаемых в полностью свернутой форме барназы. В 12 случаях значения ф! и cpTS находятся в интервале -0,1—0,2, что можно трактовать как сохранение в состояниях I и TS’ конформационных возможностей остатков исходной развернутой формы белка (D). У 14 мутантов значения ф] и фт5 колеблются в пределах от 0,2 до 0,8, что не позволяет сделать определенных заключений о происходящих по ходу ренатурации изменениях вблизи мутаций. Обращает на себя внимание и тот факт, что у всех мутантов имеет место почти буквальное совпадение значений ф] и фХ5, а имеющиеся различия, за двумя исключениями, не превышают указанные авторами пределы экспериментальных погрешностей [139]. Из этого можно сделать вывод, который в работе, однако, отсутствует, о практически идентичных, во всяком случае не различаемых используемым методом, конформационных возможностях белковой цепи барназы в промежуточном и переходном
402
Таблица III.6
Разности изменений свободной энергии (ккал/моль) промежуточных (I), переходных (TS) и полностью свернутых (IV) состояний мутантов относительно денатурированных (D) по сравнению со свободной энергией барпазы (AAGp_i, ДДС|)_т$, AAGp_^) н значения структурных параметров <pj и при развертывании белковой цепн [139]
Место мутации Элемент вторичной AAGD-j aaGd-ts aagd_n <PI
структуры
Не--->Val-4 N-Конец 0 0 0,7 0 0
Asn---»А1а-5 » 0,2 0,2 2,1 0 0,1
Thr-»Ala-6 а-Спираль 0,7 0,7 2,3 0,3 0,3
Val-> Ala-10 » 1,0 1,3 3,6 0,3 0,3
Tyr-» Ala-13 » 1,5 1,9 3,7 0,4 0,5
Ala->13/Ala-17 » 1,5 2,0 4,6 0,3 0,4
Leu-»Ala-14 » 2,4 2,8 4,5 0,5 0,6
Thr---»Ser-16 » 1,3 1,5 1,7 0,8 0,9
Tyr---> Ala-17 » 1,0 1,3 2,3 0,5 0,6
His---»Gln-18 » 1,2 1,2 1,4 01 0*9
Asn---» Ala-23 Ol-Петля 0 -0,1 2,5 0 0
He---»Val-25 » -0,3 -0,3 1,2 -0,2 -0,2
Thr---> Ala-26 » 0 0 2,0 0 0
Glu-»Gly-29 а2-Спираль -0,2 -0,2 1,9 -0,1 -0,1
Val-> Ala-36 02-Петля -0,3 -0,1 1,3 -0,2 -0,1
Asn-»Asp-41 аз-Спираль 0 -0,1 2,5 0 0
Val---» Ala-45 » -0,5 -0,3 1,8 -0,3 -0,2
Ile-»Val-51 3] -Структура --0,3 -0,3 1,8 -0,1 -0,1
Asp-» Ala-54 » -0,5 -0,5 3,1 -0,2 -0,2
Предыдущая << 1 .. 186 187 188 189 190 191 < 192 > 193 194 195 196 197 198 .. 232 >> Следующая

Реклама

c1c0fc952cf0704ad12d6af2ad3bf47e03017fed

Есть, чем поделиться? Отправьте
материал
нам
Авторские права © 2009 BooksShare.
Все права защищены.
Rambler's Top100

c1c0fc952cf0704ad12d6af2ad3bf47e03017fed