Введение в популяционную генетику - Ли Ч.
Скачать (прямая ссылка):
BB AA bb BB Aa bb BB aa bb
Bb Bb Bb
Y Y* 2 YZ1 Y, о Y io Ym Y oi Yot
f p2 u2 p22uv p2 v2 2pqu2 2pq2uv 2pqv2 q2 и2 q2 2uv q2 f2
L 2q 2 q 2q q-p q --- p q --- p --- 2p --- 2 p --- 2p
D Ф q2 q2 --- pq --- pq --- pq P~ P3 p2
L 2v v --- u --- 2и 2v v --- u --- 2« 2v v --- u --- 2«
D V2 --- uv U2 u2 --- HD u2 v2 --- uv u2
LL 2q2v 2q (v --- u) --- 2q2u (q --- p) 2v (?--- P) (f --- «) --- (<7 --- p)2« --- 2p 2u --- 2p(v --- u) 2p-2u
LD 2 qv% --- 2quv 2qu2 (q---p) v2 --- (q --- p)uv (9 ---P) «2 --- 2pv2 + 2p«o --- 2p«2
DL 2q2 v q2 (v --- u) --- 2<72h --- 2p<ju --- pq (v --- u) 2 pqu 2p2 и p2 (t) --- h) --- 2p2u
DD q2 v2 --- q2 uv q2u2 --- pqv2 -j- pquv --- pqus p2 D2 --- p2 ay p2 a2
0 = 2fcY = 2<7Р2У2. + 2pq (q —р) Уг . — 2pq% 70 =
= 2pq [р (Р2. - Кх.) + q {Yx. - Ke.)] = 2ptf,
где Y2 = u2Y22+2uvYn + v2Y20— среднее значение количественного признака для генотипа АА. Аналогичным образом Y\ и У0 — средние значения для генотипов А а и аа. Приведенное выше выражение для 0 идентично (33) из гл, 3. Знаменатель 2fc2 преобразуется в 2pq, и для локуса (А, а)
что совпадает с соответствующим выражением для одного локуса. Дисперсию доминирования можно рассчитать таким же способом, как и раньше. Соответствующий пример рассмотрен в табл. 10.6.
Таблица 10.6
Расчет главных эффектов и компонент дисперсии, связанных с «факторами»
(А, а) и (В, Ь), которые имеют частоты (р, q) = (0,4; 0,6) и (и, v) = (0,75; 0,25)
Значения количественного признака для генотипа, Y Частота генотипа, /
ВВ ВЪ ЬЪ ВВ Bb bb
АА' 18 12 6 0,09 0,06 0,01
Аа 11 28 5 0,27 0,18 0,03
аа 3 5 7 0,2025 0,1350 0,0225
Суммарная генетическая дисперсия Оу =2/У2---У2=219---(12)3 =75,00
f Y Локус (А, а) AW Локус (В Ь) Д 2К
f д7 / У /' AY
АА 0,16 15 0,40 ---2 --- 15 ВВ 0,5625 9,24 0,75 ---7,92 ---19,20
Аа 0,48 17 0,60 +13 ВЬ 0,3750 17,16 0,25 +11,28
аа 0,36 4 bb 0,0625 5,88
Р == 7,0 р = —3,12
Локус (А, а) Локус (В, Ь) Сумма
о2 =0,48(7)2 = 23,52 о2 = 0,375 (3,12)2 = 3,6504 о| = 27,1704
о2 = (0,4)2 (0,6)2 (15)2 = 12,96 о2 =(0,75)2(0,25)2 (19,2)2=12,96 Стд =25,9200
Сумма о2а> aj = 36,48 o2Bib)= 16,6104 53,0904
Компоненты, обусловленные взаимодействием, мы до сих пор не рассматривали. Однако, пользуясь табл. 10.5 и общепринятой методикой получения 02/2fc2, всегда можно провести расчет для любого данного ряда (контраста). Выполнив обычные алгебраические преобразования, можно убедиться, что такой расчет эквивалентен следующей арифмети-12*
Расчет взаимодействий между двумя локусами. Значения количественных признаков
для генов У
ВВ вь ЬЬ
АА 18 12 6
Аа 11 28 5
аа 3 5 7
V
+ 1 --- 1
---1 + 1
^2Х = --- -17
+ 1 --- 1.
--- 1 + 1
Дм = 23
+ 1 ---1
--- 1 + 1
'
+ 1 --- 1
--- 1 + 1
Д,, =— 16
:+25
+ 1 ---2 + 1
--- 1 +2 --- 1
Д22—Д21 = + 40
+ 1 ---2 + 1
--- 1 +2 --- 1
Дха—Дц = —40
+ 1 ---1
---2 +2
+ 1 --- 1
+ 1 --- 1
---2 +2
+ 1 --- 1
Д22 *— ^Х2 —38
Д21 — Дц--------------42
+ 1 ---2 + 1
---2 +4 ---2
+ 1 ---2 + 1
Д22 —1 Д21 — Дх2 +Д XI — 80
ческой процедуре. Выпишем значения количественных признаков для девяти генотипов так, как это сделано в (11), чтобы было ясно соответствие между генотипом и его значением. Найдем теперь разности первого порядка значений У, используя коэффициенты, приведенные в табл. 10.7 для конкретного числового примера. Например, разность, приведенная в верхнем левом углу табл. 10.7, есть
