Введение в популяционную генетику - Ли Ч.
Скачать (прямая ссылка):
Мать — дочь: г = ;
Мать — сын: г = 1^1/2 = 0,707;
Отец — дочь: г = 1/1/2 = 0,707; Отец — сын: г = 0.
(12)
(13)
§ 6. МЕТОД/ГО
Метод переходных матриц (гл. 4) можно с успехом применить и к генам, сцепленным с полом. В этом случае вместо одной матрицы Т, используемой для аутосомных генов, применяют четыре переходные матрицы, составленные для пар родитель—ребенок.
-дочь
я о
J____1_
2 2
Р я — дочь
q O'
Р Я
Заметим, что переходная матрица для пары мать — дочь, Г33, равна матрице Т для аутосомных генов. Как и раньше, буквой О с соответствующими индексами обозначается матрица «независимости».
t я- •)¦
В такой системе обозначений переходная матрица для пары отец — сын 722 = 022, что говорит о независимости генотипов отца и сына. Как и д^я Т, здесь тоже имеются четыре переходных матрицы для сибсов в соответствии с тем, что данный сибс может быть мужского или женского пола. Для пар сестра — сестра, сестра — брат, брат — сестра, брат — брат соответственно эти матрицы следующие:
^23“
S33 — у 1з.
¦1-г.
П32 + — 032,
(15)
22-
Совместные распределения полных сибсов по генам, сцепленным
Таблица 7.5 с полом
Сестра --- сестра аа
АА Аа
АА •у Р20 + Р) у Р2Я 0
Аа 1 , 3 Tpq2
Tpq Ypq
аа 0 уде2 ~<?2(i+<?)
АА
Аа
аа
Сестра — брат А а
yp2(i+/>) -jp2q
уде (1+2/») уде(1+2<?)
1
-pq*
~~Я2 0 + я)
Брат — сестра АА Аа
Брат — брат А
1 , , 1 1 1 1
~ур 0 + р) 2 РЯ (1+2р) ~?РЯ2 А у РО+Р) уде
1 1 1 1 1
---Р2Я 2 де(1+2<?) у<?2(1+<?) а уде у я(1 + я)
2 н 4
Коэффициенты в линейных выражениях для каждого из S обозначают характер родства. Так, например, S22 = — /22+-~ 022 означает, что
два брата либо имеют по идентичному гену, либо оба гена у них независимы. Выписав условные вероятности (15) и умножив строки на начальные вероятности, мы получим совместные распределения полных сибсов в отношении сцепленных с полом локусов (табл. 7.5). Генетические корреляции между полными сибсами будут следующими:
3 1
Сестра — сестра: г — — ; Сестра — брат: г =----— = 0,35355,.
4 2V 2
Брат — сестра: г — —; Брат — брат: г — — . (16)
2V 2 2
Матрица условных вероятностей и корреляция между
Мать --- дочь Мать --- сын
Родитель --- ребенок Т’зз Т 32
1 '-VT
Г= 2
Сестра --- сестра Сестра --- брат
Полные сибсы ¦^зз = Т33 Н --- /33 S32 = ~ T32-h 032
3 2 V 2
Г~ 4
Бабка --- внучка Бабка --- внук
Со стороны матери ТззТзз= Тзз -j- ---~ Озз T33 'Г 32 = Т32 + ~^~032
1 ,-±л/±
Г ~ 4 2 V 2
т32 Тъз --- Т33 Т32 Т22 = 032
Со стороны отца 1 Г = 0
2
Тетка --- племянница Тетка --- племянник
Со стороны матери S33 Т33 = --- Т33 + --- 033 S33 Т32 = --- Т32 + --- 032
4 4 4 4
3 г = ---l/"---
Г~ 8 4 V 2
S32 Тгз --- --- Т33 Н------ 033 ^32 Т22 = О32
Со стороны отца 1
г = 0
Матрицу условных вероятностей для других родственников можно получить перемножением соответствующих матриц, как и в случае аутосом-ных генов. Правда, типов родственных связей для генов, сцепленных с полом, существует во много раз больше, чем для аутосомных генов, поскольку всех рассматриваемых индивидуумов надо дифференцировать по полу. Здесь нет необходимости перечислять всех близких родственников; мы проиллюстрируем данный метод, рассмотрев пары дед—внук и родственников типа дядя—племянник. Для каждого варианта существует восемь различных типов родства. Результаты представлены в табл. 7.6, где сделано допущение, что старший родственник задан.
