Математическая биофизика клетки - Иваницкий Г.Р.
Скачать (прямая ссылка):
— распад, продолжительность цикла 155
Регуляторная функция 33, 93, 95, 96,
98, 99
Регуляторные ферменты 20, 30 Регуляция генов 79 Регуляция ферментов ------аллостерическая 20
— — изостерическая 20, 40, 41 Реентри (см. ревербератор)
— математические модели 144
— условия 197
Реология клеточных мембран 226 Рибонуклеаза
— панкреатическая 267
— Т1 267
Седло 48
Сигмоидальная кинетическая кривая
38, 40 Системный эффект 78 Сканирующий микроскоп
------оптический 238
------электронный 228
Скачкообразная деполяризация ИЗ Скорость
— .Деполяризация, максимальная ^max 198
— минимальная 199
— неустойчивая 199
— размножения источников волн 178
— распространения волн 195 Сложный фокус 49
Состав второго ранга 273 Спектр — изображения (частотная характеристика изображения) 204
— объекта (частотная характеристика объекта) 205
Спирализация
— первичной структуры полифер-ментной системы 81
— хромосом, набор 262 Спиральные волны (см. ревербератор) Стационарная (особая) точка 47 Стехиометрическая
— структура 81
— эффективность энергетического метаболизма 86
Субстратное угнетение -----открытой ферментативной реакции 52, 59, 65, 78
-----ферментов 18, 27, 30, 39, 43, 52,
78
TEA (тетраэтиламмоний) 133 Теорема А. Н. Тихонова 51, 104, 106 Третичная структура полиферментной системы 83 Триггер биохимический 71, 78, Триггерные свойства -----мембран ИЗ
-----ферментативных реакций 71, 78
Угнетение конечным продуктом 20 Узел 48
Уравнение скорости реакции
--------S, Л8з 17
--------Sx S2 26
Б
--------Sj S2 с субстратным угнетением 27
---------Sj E%T) S3 35, 37
---------Sj + S„ Л. Ss + S4 с упорядоченным присоединением субстратов 28, 29
---------Si + S.^S'i + s; С субстратным угнетением 30 ---------S1 + S2E(bT)s3 + S4 45
---------ZSW> 2S^, Е (R, Т) оли-
гомер, подверженный переходам R0^T0 34
---------2SiE<bT)i:Sy, Е (R, Т) тетрамер, обратимо диссоциирующий на два димера R0 ^ 2Т0 37 Уравнения возбудимой мембраны
------— Зимана 105
•--------Нобла 2-го порядка (N2) 104
---------Нобла 4г-го порядка (N4) 103
---------построение по записям ионных токов 123
------Франкенхойзера 139
-------— Ходжкина — Хаксли 2-го
порядка (Н — Н2) 105 ---------Ходжкина — Хаксли 4-го порядка (Н — Н4) 105 Устойчивая деполяризация 111 Устойчивость стационарных точек 48 Уязвимость
— возникновение 172
— математические модели 179, 180
Фазовый портрет математической модели 47
Фазовый портрет, нуль-изоклины уравнений
— — — мембран, построенных по вольт-амперным кривым 129, 130
------------Нобла 109, 110
—--------Ходжкина •—¦ Хаксли
(Н — Н2) 108, 110
Фермент-су бстратный комплекс 16 Фибрилляция
— критическая масса 184
— математические модели 178
— параметры, ее контролирующие 179
— условия возникновения 178 Фокус 48
Фокусные величины 49 Фосфофруктокиназа (КФ 2.7.1.11), регуляция 52, 78, 93, 98, 100 Фруктозо-1,6-бисфосфатаза (КФ 3.1.3.11), регуляция 100 функция
¦— отношения 32, 36 ¦— скорости 33
Футильные субстратные циклы 99,100 Характеристическое уравнение 48 Центр 49
Цикл без контакта 49 Цитратсинтетаза (КФ 4.1.3.7), регуляция 96
Частотная характеристика -----изображения (спектр изображения) 204 -----объекта (спектр объекта) 205
Эйлеров
— путь 271
— цикл 271
Эквивалентные модели реакций 73 Энергетический метаболизм
-----аллостерическая регуляция 92,
97
----- вторичная структура 81
-----входная характеристика иннци-
аторной ступени 87, 88
— -— первичная структура 80
_ — стехиометрическая модель 85 .— — третичная структура 83 Эффект депонирования 76 Эхо (ведущий центр) 160
Ядро реакций 81
ОГЛАВЛЕНИЕ
ОТ АВТОРОВ з
ВВЕДЕНИЕ 4
, # МАТЕМАТИЧЕСКОЕ МОДЕЛИРОВАНИЕ
1 БИОХИМИЧЕСКИХ СИСТЕМ
Глава первая
МАТЕМАТИЧЕСКОЕ МОДЕЛИРОВАНИЕ НЕПРОТОЧНЫХ ФЕРМЕНТАТИВНЫХ РЕАКЦИЙ 14
1.1. Два направления в моделировании ферментативных реакций 14
1.2. Ферменты — белковые катализаторы и регуляторы ............. 16
1.3. Метод графов .............................................. 21
1.4. Модели реакций, катализируемых одноцентровыми ферментами 25
1.5. Модели реакций, катализируемые олигомерными ферментами 30
E(R,T)
1.6. Свойства реакции S, ~~ S., ................................ 37
E(R,T)
1.7. Свойства двухсубстратной реакции St -}- S.2 ^-— S3 -f- S4 . 44
Глава вторая
МАТЕМАТИЧЕСКОЕ МОДЕЛИРОВАНИЕ
ПРОТОЧНЫХ ФЕРМЕНТАТИВНЫХ РЕАКЦИЙ 46
2.1 Общие методы исследования системы обыкновенных дифференциальных уравнений второго порядка ........................ 46
Е
2.2. Модель открытой реакции St ^ S2 с субстратным угнетением... 52
2.3. Модель двухсубстратной реакции с субстратным угнетением 59
