Генетика популяций - Хедрик Ф.
ISBN 5-94836-007-5
Скачать (прямая ссылка):
Пример 11.13. При скрещивании между родственными видами и последующем анализе ЛКП были идентифицировали гены, которые определяют главные морфологические различия между видами - например, между маисом (кукурузой) и его диким предком теосинте (Doebley et al., 1995). У мексиканского аксолотля, Ambystoma mexicanum, есть производная форма развития - педоморфоз, при котором существует только водные формы аксолотля, т.е.метаморфоз отсутствует. С другой стороны, родственная саламандра, A.tigrinum - облигатный метаморф. Как показали скрещивания (Tompkins, 1978), различия между этими видами первично обусловлены одним рецессивным геном у производной формы аксолотля. Для локализации вовлеченного в метаморфоз гена провели обратное скрещивание (Voss, Shaffer, 1997) между метаморфными особями в поколении Fj и изучили сегрегацию по 262 ПДРФ-маркерам и состояние метаморфоза. Таблица 11.12 суммирует эти данные для трех сцепленных маркеров, которые показывали значительную ассоциацию с метаморфозом. На рисунке 11.29 даны LOD баллы по исследуемому региону и показано, что наиболее вероятная позиция ЛКП - приблизительно 30 сМ в пределах центрального маркера, AFLP32.17. Как становится ясно из этого исследования, такие методы можно использовать для картирования ЛКП, обусловливающих даже сложные (комплексные) признаки организма, о которых нет детальной генетической информации.
ТАБЛИЦА 11.12. Сегрегация гетерозигот и гомозигот для трех ПДРФ-маркеров и различия жизненного цикла у саламандр Ambystoma (по Voss and Shaffer, 1997).
AFLPll. 7 AFLP32. 17 AFLP34. 5
Гет. Гом. Гет. Гом. Гет. Гом.
Метаморф 03 39 10 42 7 41 8
Педоморф 03 9 22 5 26 7 24
AFLP34.5 AFLP32.17 AFLP11.7
Рисунок 11.29. LOD баллы для трех сцепленных ПДРФ-маркеров и сегрегация различий в жизненном цикле у саламандр Ambystoma (по Voss, Shaffer, 1997).
Доступность многих маркеров у человека (и некоторых других организмов) позволила локализовать гены для многих сложных поведенческих признаков. Например, были попытки локализации генов, вызывающих маниакальную депрессию, шизофрению и гомосексуальность, хотя эти открытия и не были подтверждены последующими исследованиями. (см. пример 11.14). При использовании множества маркеров выполняется широкий ряд статистических тестов и вероятность значимых результатов высока, даже если уровень значимости низкий. Другими словами, вероятность ложно-положительной ошибки (тип I), выявляющей ассоциацию там, где имеется только случайный эффект, высока. Поправка для множественных тестов, например поправка Бонферрони, может быть использована для снижения уровня значимости а. Поскольку многие маркеры могут быть сцеплены, более подходящим считается перестановочный тест (Churchill, Doerge, 1994). Если используется несколько тестов, то LOD балл, необходимый для статистической значимости, может быть выше.
Пример 11.14. При исследовании 40 семей с братьями-гомосексуалиста-ми (геями) Хамер с сотрудниками (Hamer et al., 1993) предполагали, это на Х-хромосоме находится ген, определяющий гомосексуальность, что согласовалось с опубликованными данными. Недавно, Райс с сотрудниками (Rice et al., 1999) исследовали эту же Х-хромосому (Xq28) у 52 пар сибсов мужчин-геев. В отличие от более раннего исследования, не было увеличения более чем на 50% от ожидаемого перекрывания четырех вы-
соко вариабельных микросателлитных маркеров, относящихся к участку Х-хромосомы длиной 12,5 сМ.Для этого участка были вычислены LOD баллы и оказалось, что все они отрицательные и нет статистической значимости (рисунок 11.30). Действительно, эти LOD баллы были так низки, что можно исключить наличие такого гена в данном регионе Х-хромосомы. Поскольку теоретически против гена гомосексуальности действует сильный отбор, эти отрицательные результаты не удивительны. Не ясно, является ли значимость, обнаруженная Хамером, результатом ошибки I типа, или она действительна, так как они формировали исследуемую выборку способом, который мог отклонить их результаты. Очевидно, что это пример «ошибочной идентификации» ЛКП, обусловливающих комплексный поведенческий признак у человека.
Количество исследований, оценивающих наличие ЛКП, быстро растет. До сих пор казалось, что существенная часть генного влияния принадлежит одному или нескольким локусам (Lynch, Walsh, 1998; Kearsey, Farquhar, 1998). Однако такой вывод обусловлен статистическим отклонением, которое приводит к переоценке эффекта предполагаемых ЛКП. Сейчас в генетике наступает волнующее время, когда кажется достижимой возможность локализации и исследования генов, действительно влияющих на любой признак любого организма. В ближайшем будущем мы будем разбираться в эволюции количественных признаков гораздо лучше, чем сейчас.
о.о
0.0 5.0 ю.о
О Локализация на карте (сМ) оо "ч о ?с й S >с
й г = сл
