Научная литература
booksshare.net -> Добавить материал -> Биология -> Горленко М.В. -> "Мультисубстратное тестирование природных микробных сообществ" -> 5

Мультисубстратное тестирование природных микробных сообществ - Горленко М.В.

Горленко М.В., Кожевин П.А. Мультисубстратное тестирование природных микробных сообществ — М.: Макс Пресс , 2005. — 88 c.
ISBN 5-317-01228-7
Скачать (прямая ссылка): lultimasortatnoetestirovanieprirodnih2005.djv
Предыдущая << 1 .. 2 3 4 < 5 > 6 7 8 9 10 11 .. 24 >> Следующая

его части. Например, показано, что в ячейках набора GN представлены в
основном популяции у-протеобактерий. По данным генетических методов
разнообразие микроорганизмов, развивающихся в ячейках системы BIOLOG,
существенно ниже разнообразия в исходных образцах. Вероятно, в ячейках
набора GN растут копиотрофные микроорганизмы с относительно высокой
скоростью роста на богатых питательных средах (Garland, 1998).
Кроме того, не регистрируется реакция почвенных микромицетов, поскольку
мицелий грибов практически не дает цветной реакции с применяемыми в МСТ
соединениями тетразолия. Для дифференциального анализа грибов фирма
BIOLOG предложила особый набор ресурсов FF с индикатором МТТ (бромид
диметилтиозолил-дифенилтетразолиум) и комплексом антибактериальных
антибиотиков (гентамицин, рифампицин и стрептомицин при концентрации 50,
100 и 50 mg/ml соответственно). Предполагается, что в этом случае
полученная информация будет отражать особенности грибного блока.
Вместе с тем, как показывают эксперименты, учитываемая часть микробного
сообщества дает достаточную информацию о состоянии всего сообщества.
Можно предположить, что СПС в основном связан с метаболической
активностью аэробных гетеротрофных бактерий с относительной r-стратегией.
Спектр не отражает в точности непосредственную активность микробов in
situ, т.е. проблема "классических" микробиологических методов, до конца
не снимается. Это связано с тем, что формирование спектра зависит от
многих причин, как специфических для данного образца, так и общих.
По мнению Гарланда (Garland, 1998), развитие окраски есть функция
1 5
относительного обилия популяций различных микроорганизмов, скоростей их
роста и эмерджентных эффектов в результате взаимодействия популяций в
ячейках. Разные популяции MOiyr расти с одинаковой скоростью, но при этом
интенсивность восстанавления тетразолия может существенно различаться
(Haack et al, 1995). Актуальный функциональный потенциал in situ не
обязательно проявится в МСТ (Zak et al., 1994). В ячейках реализуются
самые разные межмикробные взаимодействия (конкуренция, мутуализм,
комменсализм, антагонизм, кометаболизм субстратов и т.п.), следствием
которых MOiyr быть различные синергические эффекты (Garland, 1998).
Поэтому формирование окраски носит нелинейный характер (Garland et.al.,
1997).
Нерешенным остается вопрос о том, потребляется ли конкретный субстрат в
основном одной популяцией или комплексом взаимодействующих популяций.
Более того, информация о СПС для конкретных микробных популяций не
позволяет удовлетворительно предсказать СПС модельного сообщества,
сформированного из них (Haack et al., 1995). По этой причине сложно
напрямую связать функциональное разнообразие микробного комплекса in situ
с разнообразием функциональных откликов в МСТ (Mills, Bouma, 1997).
Важнейшим фактором, влияющим на формирование СПС, является исходная
численность микроорганизмов в исследуемой суспензии (в данном образце).
Чем выше исходная плотность, тем быстрее и интенсивнее развивается
окраска ячеек. Время инкубации является весьма существенным фактором,
который может повлиять на количественные и качественные особенности СПС
одного и того же микробного сообщества в зависимости от исходного обилия
клеток. Для контроля этого эффекта в системе BIOLOG предлагается
стандартизация исходного обилия микробных клеток, что повышает уровень
воспроизводимости СПС. Процедура стандартизации исходного обилия
микроорганизмов и инкубационного времени действительно может оказаться
эффективной, однако такой подход не так то просто реализовать на практике
при работе с самыми разными образцами. Кроме того, неясно какой из
методов количественного учета (посев на среды, общая численность по
данным микроскопии,
1 6
прямой учет "активных" клеток) соответствует поставленной в данном случае
задаче как оптимальный метод определения исходного обилия (Garland,
1998). Существенный интерес представляет вопрос о минимальном пороговом
уровне плотности микроорганизмов, при котором регистрируется окраска
ячеек. В зависимости от метода учета (прямая микроскопия, посев на
питательную среду) и особенностей анализируемого объекта (чистая
культура, природные микробные комплексы) пороговая концентрация клеток
для системы BIOLOG варьирует в широком диапазоне от 104 до 108 клеток/мл
(Garland, 1998; Mills, Bouma, 1997; Winding et al.,1997; Haack et al.,
1995). По нашим данным для системы ЭКОЛОГ уверенная регистрация формазана
в ячейках обеспечивается после достижения уровня обилия 107-108 клеток/мл
при учете люминесцентной микроскопией. При исходной плотности 108-
109кл/мл окраска в планшетах BIOLOG появляется через 1-3 часа, что, по
мнению некоторых исследователей, открывает новые направления
кинетического анализа формирования СПС в ходе инкубации, как важной
характеристики сообществ (Garland, 1998).
По нашему мнению, более интересной представляется работа с почвенными
Предыдущая << 1 .. 2 3 4 < 5 > 6 7 8 9 10 11 .. 24 >> Следующая

Реклама

c1c0fc952cf0704ad12d6af2ad3bf47e03017fed

Есть, чем поделиться? Отправьте
материал
нам
Авторские права © 2009 BooksShare.
Все права защищены.
Rambler's Top100

c1c0fc952cf0704ad12d6af2ad3bf47e03017fed