Научная литература
booksshare.net -> Добавить материал -> Биология -> Фрайфелдер Д. -> "Физическая биохимия " -> 138

Физическая биохимия - Фрайфелдер Д.

Фрайфелдер Д. Физическая биохимия — М.: Мир, 1980. — 580 c.
Скачать (прямая ссылка): fizicheskayabiohimiya1980.djvu
Предыдущая << 1 .. 132 133 134 135 136 137 < 138 > 139 140 141 142 143 144 .. 218 >> Следующая

М = 1,56- 108(tr,b)
0,60
(9)
в котором
TR, в “
Г'Н20 о R ’
(10)
где т]н2о иг] — вязкости воды и растворителя соответственно, а все измерения проведены при 25°С, Для кольцевых молекул ДНК константа и показатель степени будут другими, но до сих пор они не оценены.
Большая польза этого метода заключается в том, что для растворов, содержащих молекулы различных 'размеров, наблюдаемая величина М соответствует наибольшей из присутствующих молекул (в отличие от того, что при измерениях [г\] получается усредненное значение). Следовательно, в случае очень хрупких молекул на систему не будет влиять распад части молекул.
ТАБЛИЦА 13-2
Размеры различных молекул ДНК, определенные при измерении вязкоэластичности3
Молекулярная масса
Источник ДНК метод измерения другие
вязкоэластичности методы^
Фаг Т7 Е, coli 25zt2- 10е 25*10е
Фаг Т2. Е. coli 109it6’ 10е И МО®
Е. coli 2,7*109 2,6*109
Bacillus subtilis 2,0*109 1 * 109---4- Юэ
Drosophila melanogaster 41ш3*109 ---
Drosophila americana 79^10-10° ---
а Данные взяты из Klotz L. С., Zimm В. Я., J. Mol, Biol., 72, 779—800 (1972); Kave-ttoff R., Zimm B. //., Chromosoma, 41, 1—27 (1973); Kavenoff R.t Klotz L. C., Zimm B. H.> Cold Spring Harbor Symp. Quant. Biol., 38, 1—8 (1973).
в Прочерк означает, что измерения другими методами не были проведены.
Оборудование для измерений вязкоэластичности пока не выпускается промышленностью, поэтому такая работа проводится только в лабораториях Бруно Зимма и его сотрудников. Этот метод был успешно применен для того, чтобы определить М для ДНК больших бактериофагов, некоторых бактерий и хромосом из некоторых видов плодовой мушки Drosophila (табл. 13-2). Этот метод, очевидно, получит в будущем большое распространение.
Список литературы
Eigner Л, Molecular Weight and Conformation of DNA, in “Methods in Enzymology”, vol. 12B, edited by L. Grossman and K. Moldave, Academic Press, 1968, pp. 386—429.
Uhlenhopp E. L., Zimm B. tf., Rotating Cylinder Viscosimeters, in “Methods in Enzymology”, vol. 21, edited by С. H. W. Hirs and S. N. Timasheff, Academic Press, 1973, pp. 483—491.
Yang J. Т., The Viscosity of Macromolecules in Relation to Molecular Conformation, Advan. Protein Chem., 16, 323—400 (1961).
Задачи
13-1. Характеристическая вязкость [r\] ДНК равна 50 дл/г. При нагревании до 95°С в 0,01 М NaCl [т|] падает до 20. При нагревании до 90°С в 0,5 М NaCl снижается до 3. Объясните зависимость от концентрации NaCl. Каких отличий следует ожидать, если нагревание проводить в растворах NaCl, содержащих 1 М формальдегида?
13-2. Если бактерии обработать некоторыми детергентами в низких концентрациях, суспензия становится заметно более вязкой. Если эту суспензию быстро отцентрифугировать, то получится осадок, который содержит всю ДНК и РНК. Надосадочная жидкость остается все еще вязкой. Какое объяснение можно предложить для этой вязкости?
13-3. Какие из следующих пар будут давать большую вязкость при суспендировании в воде: а) две сферы с равными массами, но различными радиусами; б) твердая и пористая сфера, через которую может протекать растворитель; в) твердый и гибкий стержни; г) сфера и сфера с боковыми плоскостями?
13-4. Где молекула будет обладать большей относительной вязкостью, в воде или в 20%-ном глицерине?
13-5. Какая из следующих пар будет более устойчива к разрушению гидродинамическим сдвигом: а) линейная и кольцевая молекулы ДНК одинаковой длины; б) нативная линейная молекула ДНК и молекула, денатурированная в 1 М NaCl, имеющие одинаковую длину; в) линейная ДНК, денатурированная в 1 М и 0,01 М растворах NaCl, одной и той же молекулярной массы; г) ковалентная и перекрученная кольцевая ДНК одной и той же молекулярной массы.
13-6. Какие вы могли бы сделать заключения о структуре молекулы белка, если [г|] увеличивается при измерениях в 6 М растворе хлорида гуаниди-ния? Если она уменьшается? Какой принципиальный источник неточности при высказывании этих заключений?
13-7. В общем случае вязкость повышается при добавлении различных солей в воду, это означает, что t}oth>1. Однако в нескольких случаях для разбавленных растворов г|отн^1. Предложите возможное объяснение.
13-8. При некоторых значениях ионной силы и pH индивидуальный полинуклеотид обладает достаточно малой зависимостью г|уд/с от с и [т|] почти не зависит от сдвига. При изменениях pH зависимость от концентрации и от сдвига заметно повышается так же, как истинное значение [г|]. Каково возможное действие изменения pH?
13-9. Обычно в растворах нативной ДНК из-за жесткости молекулы наблюдается относительно небольшая зависимость [ц] от ионной силы. Однако отдельные препараты ДНК, выделенные из бактерий, обладают таким свойством, что при низкой ионной силе [rj] становится существенно меньше. Более того, если раствор разбавить прежде, чем понизить ионную силу, г|0тн оказывается выше, чем в том случае, если ионную силу понизили перед разбавлением раствора. Это не соблюдается для всех препаратов ДНК из этой бактерии. Какое возможное объяснение такого эффекта для данного образца?
Предыдущая << 1 .. 132 133 134 135 136 137 < 138 > 139 140 141 142 143 144 .. 218 >> Следующая

Реклама

c1c0fc952cf0704ad12d6af2ad3bf47e03017fed

Есть, чем поделиться? Отправьте
материал
нам
Авторские права © 2009 BooksShare.
Все права защищены.
Rambler's Top100

c1c0fc952cf0704ad12d6af2ad3bf47e03017fed