Научная литература
booksshare.net -> Добавить материал -> Биология -> Филдс Б.Н. -> "Вирусология: В 3-х т. Том 1 " -> 59

Вирусология: В 3-х т. Том 1 - Филдс Б.Н.

Филдс Б.Н., Найп Д.М., Мэрфи Ф.А., Харрисон С. Вирусология: В 3-х т. Том 1 — М.: Мир, 1989. — 492 c.
ISBN 5-03-000283-9
Скачать (прямая ссылка): virusologiyat11989.djvu
Предыдущая << 1 .. 53 54 55 56 57 58 < 59 > 60 61 62 63 64 65 .. 224 >> Следующая

ДИ-частицы мозаичного типа
Четвертый тип ДИ-частиц — не единичная определенная структура; в него входят все ДИ-частицы, имеющие сложное мозаичное перераспределение сегментов вирусного генома, т. е. такие, для образования генома которых необходимо по крайней мере несколько рекомбинационных событий. Геном ДИ-частицы мозаичного типа, представленный на рис. 6.4, очень интересен, так как он почти идентичен геному транскрибирующей ДИ-частицы с внутренней делецией, также показанному на рис. 6.4, но отличается от него наличием Z'-ствола длиной в 70 нуклеотидов, добавленного к З'-концу простой ДИ-частицы с внутренней делецией. Частицы обоих типов образовались в одной и той же вирусной популяции, следовательно, они могли возникнуть последовательно или из общего предшественника [43, 126]. 70-Нуклеотид-ный ствол, присоединенный к З'-концу транскрибирующих ДИ-частиц, обусловливает два значительных биологических эффекта: полное подавление транскрипционной активности, так как удаляется с З'-конца и переносится во внутреннюю позицию участок инициации транскрипции, а также придание частице настолько сильной интерферирующей и конкурентной способности, что она опережает в накоплении копий родственные ей транскрибирующие ДИ-частицы, в которых на З'-конце нет Z'-ствола [43, 126]. Это подчеркивает репликативные преимущества, приобретаемые ДИ-частицами VSV благодаря З'-концевым стволам, и репликативное несовершенство З'-концов, которые большую часть времени осуществляют транскрипционную деятельность.
Возможно возникновение множества различных видов вирусной РНК мозаичного типа. Происходящие при этом перераспределения ведут к появлению довольно сложных и причудливых ДИ-РНК-геномов, что обсуждается ниже на примере ДИ-частиц вирусов гриппа и леса Семлики. Не исключено даже, что обнаружатся ДИ-частицы, содержащие участки РНК нескольких различных вирусов и (или) участки РНК клетки-хозяина, разбросанные между участками вирусной РНК [110а, 117а].
Возможные механизмы образования ДИ-геномов
В связи с тем что в настоящее время нет хорошей бесклеточ-ной системы для изучения образования ДИ-частиц (и вообще рекомбинаций РНК), умозрительные теории о возможных механизмах перераспределения РНК генома можно создавать только на основе изученных структур. Наиболее правдоподобная и широко принятая общая модель образования ДИ-частиц называется моделью «обратного копирования» [67, 102]. Согласно этой модели, репликаза сходит с матрицы и несет новую цепь с собой, чтобы возобновить синтез и продолжить элонгацию цепи РНК на новой матрице (или на новом участке старой матрицы). Возникновение по этому механизму наиболее распространенного типа ДИ-частиц (с коротким стволом, 1-го типа) схематически представлено на рис. 6.5.
В этом случае во время синтеза новой минус-цепи РНК на плюс-рибонуклеопротеиновой матрице репликаза начинает синтез на участке инициации на З'-конце (участок Z' на рис. 6.4). Часть пути она проходит через цистрон большого белка L, затем покидает плюс-матрицу (неся с собой З'-конец короткой ново-синтезированной цепи) и возобновляет синтез, используя в качестве матрицы участок новосинтезированной цепи, расположенный близко от ее 5'-конца. Потом она проходит короткое расстояние к 5'-концу, синтезируя последовательность, входящую в состав короткого ствола (Z' на рис. 6.4), и завершая этим формирование новой геномной РНК ДИ-частицы типа «ручки сковороды», или короткого (1-го типа) ствола. В обзорах Перро [123] и Лазарини и др. [97] эта модель расширена, для того чтобы объяснить, как благодаря «прыгающим репликазным комплексам» или аномальной репликации типа «обратного копирования» могут появляться ДИ-частицы любого известного типа. Например, «шпилькообразные» геномы 2-го типа могут возникать в основном так же, как и ДИ-геномы стволового типа, за исключением того, что участок возобновления синтеза для репли-казы будет расположен на З'-конце новосинтезированной цепи или вблизи от него, а не на близком к 5'-концу участке. Не исключено, что репликаза «предпочитает» некоторые нуклеотидные последовательности в качестве участков возобновления синтеза. Шуберт и др. [136] предполагают, что предпочтительным местом возобновления синтеза может быть последовательность GGUCUU в позиции 43—48 у 5'-конца вирусной РНК, так как та же последовательность присутствует в положении 4—9 на З'-конце геномной РНК вируса. В связи с тем что З'-конец вирусной РНК служит участком инициации для репликазы-транс-криптазы, последовательность этого гексамера может быть частью последовательности для распознавания промотора.
У
в
Г
Рис; 6.5. Модель образования РНК-содержащих ДИ-геномов с концевыми стволами, или «ручками сковороды» (тип 1 ДИ-генома на рис. 6.4), возникающих в результате репликативных ошибок типа обратного копирования. Эта модель предложена авторами в 1977 г. [67, 102]. Обратите внимание, что когда 5¦'-конец вирусной минус-цепи копируется с З'-конца плюс-цепи матрицы (А), комплекс репликазы '(черный кружок) и синтезируемой РНК сходит с матрицы (Б). Затем синтез возобновляется возле 5'-конца новосинтезированной минус-цепи (штриховая линия с точками) и завершается на 5'-конце этой новой матрицы (В). В результате (F) синтезируется ДИ-геном частицы с Z'-стволом (широкая сплошная линия) на З'-конце. Таким образом, концы ДИ-частиц этого типа представляют собой автокомплементарные стволы, или «ручки сковороды».
Предыдущая << 1 .. 53 54 55 56 57 58 < 59 > 60 61 62 63 64 65 .. 224 >> Следующая

Реклама

c1c0fc952cf0704ad12d6af2ad3bf47e03017fed

Есть, чем поделиться? Отправьте
материал
нам
Авторские права © 2009 BooksShare.
Все права защищены.
Rambler's Top100

c1c0fc952cf0704ad12d6af2ad3bf47e03017fed