Ферменты 2 - Диксон М.
Скачать (прямая ссылка):
обозначены три цепи, образующиеся при расщеплении одиночной цепи
химотрипсиногена А указанными протеиназами. Три образовавшиеся цепи
удерживаются вместе дисульфидными мостиками.
742
Глава 10
Отщепление части исходной пептидной цепи при биосинтезе ферментов
является достаточно общим феноменом. Известно, что ряд гидролитических
ферментов образуется из неактивных предшественников при отщеплении части
полипептидной цепи с аминного конца молекулы; в результате появился
термин "активационный пептид", употребляющийся применительно к
отделяющейся части цепи, который претерпевает дальнейшее расщепление с
образованием ряда пептидов. При образовании трипсина от предшественника
отщепляется пептид, состоящий из шести аминокислотных остатков, но в
некоторых случаях активационный пептид значительно больше и составляет
значительную часть молекулы предшественника. Например, пепсин свиньи
образуется при отщеплении 42 остатков аминокислот из 363, входящих в
состав цепи пепсиногена [2376], при образовании карбоксипептидазы А
отщепляется 60 остатков и остается цепь из 300 аминокислот [3408], а в
случае карбокси-пептцдазы В быка отщепляется около 200 остатков от цепи
предшественника, состоящего из 505 аминокислот [903]. (В отличие от
карбоксипептидазы В образование карбоксипептидазы А быка, но не других
видов животных осложнено тем, что она прочно связана с предшественником
другой пептидазы; предшественник удаляется при участии специального
фермента до того, как прокарбоксипептидаза А может быть активирована
[3408]).
По-видимому, мы можем рассматривать отщепление части молекулы
предшественника (исходно синтезированной молекулы) с аминного конца как
общее явление при биосинтезе ферментов, поскольку аминокислоты, с которых
начинается синтез (формилметионин в случае белков бактерий [798] и
метионин в случае белков животных [2173]), обычно отщепляются за счет
ферментативного гидролиза, иногда даже до того, как завершается
,формирование другого конца цепи!
Особенности первичной структуры
На рис. 10.4-10.6 приведены последовательности аминокислотных остатков
полипептидной цепи трех ферментов. Хотя эти последовательности в конечном
счете определяют общую форму молекул, такой метод изображения дает о ней
очень приблизительное представление, ибо структуру молекулы нельзя
удовлетворительно изобразить какой-либо двумерной диаграммой. Например,
группы, соединенные дисульфидными связями и, следовательно, сближенные в
пространстве, могут находиться далеко друг от друга вдоль полипептидной
цепи; то же самое может относиться и к группам, о которых известно, что
они входят в состав относительно небольшого субстратсвязываю-
Рис. 10.4. Аминокислотная последовательность алкогольдегидрогеназы из
печени лошади ("этанол-активный" изофермент). S-форма отличается в
положениях 17, 94, 101, 110, 115 и 366.
Ala-Gin-Ser -Val-Fro -Tyr-Gly-Val-Ser- Gin-lie - Lys - Ala -Pro- Ala-Leu-
His-Ser -GIn-Gly - Tyr-Thr-Gly-Ser-Asn-Val-Lys-Val-AIa-Val-Ile - Asp-Ser-
Gly-Ile - Asp-Ser-Ser-His-Pro - Asp -Leu-Lys-Va! -AJa-GJy-GJy-Ala-Ser-
Met-Val-Pro-Ser- Glu-Thr-Pro-Asn-Phe-Gln-Asp-Asp-Asn-Ser - His - Gly -
Thr-His-Val - Ala- Gly -Thr-Val-Ala-Ala-Leu-Asn-Asn-Ser- He - Gly -Val-
Leu-Gly-Val- Ala-pro-Ser-Ser - Ala-Leu-Туг- A!a-Val-Lys-VaI-Leu-GIy-Asp-
Ala-Gly - Ser-Gly-Gln-Tyr-Ser -Trp-Ile -lie - Asn-Gly-Ile - Glu-Trp-Ala-
lie - Ala-Asn-Asn-Met-Asp - Val - He - Asn-Met-Ser -Leu-Gly-Gly-Pro-Ser-
Gly -Ser - Ala- Ala-Leu-Lys-Ala-Ala-V*l - Asp - Lys-Ala-Val-Ala-Ser-Gly-
Val-Val-Val-Val-AIa-AIa-Ala-Gly-Asn-Glu-Gly-Ser -Thr-Gly -Ser-Ser -Ser -
Thr- VaJ - Gly -Tyr- Pro -Gly- Lys -Tyr- Pro- Ser - Val -He - Ala-Val-
Gly-Ala-Val -Asp-Ser -Ser - Asn-Gln-Arg-Ala-Ser- Phe-Ser -Ser- Val - Gly
-Pro - Glu-Leu -Asp -Val - Met-Ala - Pro-Gly-Val-Ser - lie - Gin-Ser -
Thr-Leu-Pro-Gly-Asn-Lys -Tyr - Gly-Ala-Tyr-Asn-Gly-Thr -Ser - Met-Ala-Ser
- Pro-His-Val-Ala-Gly-Ala-Ala-Ala-Leu-Ile - Leu-Ser-Lys - His - Pro-Asn -
Trp -Thr-Asn-Thr- Gin-Val - Arg-Ser - Ser - Leu-Gin-Asn-Thr-Thr-Thr-Lys -
Leu-Gly-Asp-Ser - Phe -Tyr -Tyr- Gly -Lys- Gly- Leu-Tle - Asn-Val- Gin-
Ala-Ala-Ala- Gin
Рис. 10.5. Аминокислотная последовательность субтилизина BPN'.
Acefyl Ser Lys He - Gly-lle - Asp-Gly-Phe-Gly-Arg-IIe - Gly-Arg-Leu-Val-
Leu-Arg-Ala - Alu-Leu-Ser- Cys-Gly-Ala-Gln-Val-Val-Ala-Val-Asn-Asp-Pro-
Phe-lle -Ala-Leu-Glu -Tyr-Met-Val -Tyr- Met-Phe-Lys -Tyr - Asp-Ser - Thr-
His - Gly-Val -Phe-Lys-Glv -
Glu-Val-Lys-Met-Glu-Asp-Gly-Ala-Leu-Val-Val-Asp-Gly-Lys-Lys- He - Thr-Val
-Phe-Asn-Glu-Met-Lys-Pro-Glu-Asnrlle - Pro-Trp-Ser - Lys-Ala-Gly-Ala-Glu-
Tyr -He -Val - Glu-Ser-Thr - Gly - Val - Phe -Thr -Thr - lie - Glu-Lys-
Ala-Ser-Ala-His - Phe -Lys - Gly -Gly - Ala-Lys - Lys - Val - Val - He -
Ser -Ala-Pro-Ser-Ala-Asp-Ala-Pro-Met-Phe-Val-Cys -Gly -Val -Asn-Leu-Glu-
Lys -Tyr-Ser -Lys -Asp-Met -Thr- Val -Val-Ser -Asn-Ala- Ser - Cvs -Thr-
Thr-Asn-Cys-Leu-Ala-Pro - Val-Ala- Lys - Val- Leu-His- Glu -Asn-Phe-Glu-
