Генетика бактерий - Девис Р.
Скачать (прямая ссылка):
штамм TR251 (hisC527 cysA\M9 supD) является штаммом Cys+Hys+ (фенотип),
так как супрессор supD исправляет аук-сотрофнос.ть обеих мутаций cysA и
hisC.
Существование транспонируемых элементов (транспозонов) приводит к
необходимости введения дополнительных правил. Вставки (инсерционные
мутации) обозначают теми же тремя буквами, символами генов и номерами
аллелей, как это было описано выше. К этому добавляют символ,
обозначающий встроенный материал. Символ этот ставится после двух
двоеточий. (Например, hisC869l : : Тп 10 обозначает определенную вставку
сообщающего лекарственную устойчивость транспозона Тп 10 в ген hisC; этой
мутации дан номер 8691 аллеля his.) В символе транспонируемого элемента
две прописные буквы обозначают тип элемента. Простые последовательности-
вставки, которые содержат лишь гены, участвующие в транспозиции,
обозначают IS. Более сложные транспозоны, включающие дополнительные гены,
например гены устойчивости к лекарственному препарату, обозначаются Тп.
Выделено много вставок (включений, инсерций) Тп 10, о которых известны
лишь их положения на карте, но неизвестны те гены, которые мутировали в
результате вставки транспозона. Большинство их выделено как вставки
вблизи какого-нибудь исследуемого гена (см. эксперимент 2). Чтобы можно
было обозначать вставки Тп 10 в соответствии с их положением на карте и
тогда, когда остается неизвестным, в каком именно гене произошла вставка,
сделанное ранее Хонгом и Эймсом (Hong, Ames, 1971) предложение было
видоизменено. Все такие вставки обозначают символом из трех букв, который
начинается с буквы г. Вторая и третья буквы символа обозначают
приблизительное положение вставки на карте в минутах. Вторая буква
обозначает тот сегмент длиной 10 мин, в который попадает вставка.
Сегменты эти нумеруются по часовой стрелке от минуты 0 (а = 0-10, b = 10-
20, с = 20-30 и т. д.). Третья буква точно таким же образом обозначает
уже минуты карты внутри этих сегментов длиной в 10 мин. Например, вставка
Тп 10, локализованная вблизи гена hisW между минутами 47 и 48
генетической карты, обозначается как zeh-754 : : Тп/#; вставка ТпЮ вблизи
локуса his на 44-й минуте обозначается как zee-2 : : Тп 10. Номера
аллелей приписываются таким вставкам последовательно независимо от второй
и третьей букв символа. Таким образом, если более точное картирование
приведет к необходимости изменить трехбуквенный символ вставки, то номер
вставки все равно не изменится. В соответствии с этим правилом
используются обозначения от zaa до zjj. Для обозначения вставок во
внехромосомных элементах мы используем буквы zzy за которыми следует
буква, обозначающая внехромосомный элемент. Символом zzf обозначаются
вставки в плазмиде F'.
14
Литература
Bachman В. J., Low К. В., 1980. Linkage map of Escherichia coli K12,
Microbiol. Rev., 44, 1.
Campbell A., Berg D., Botstein D., Lederberg E., Novick R" Starlinger P.,
Szybalski ft7., 1977. Nomenclature of transposable elements in
prokaryotes. In: DNA insertion elements, plasmids, and episomes
(BukhariA. I. et al., eds.), p. 15, Cold Spring Harbor Laboratory, Cold
Spring Harbor, New York.
Chumley F. G" Menzel R" Roth J. R-, 1979. Hfr formation directed by Tn
10, Genetics, 91, 639.
Demerec M" Adelberg E. A., Clark A. J., Hartman P., 1966. A proposal for
a uniform nomenclature in bacterial genetics, Genetics, 54, 61.
Hong J.-S., Ames B. N., 1971. Localized mutagenesis of any specific small
region of the bacterial chromosome, Proc. Natl. Acad. Sci., 68, 3158.
Sanderson К. E., Hartman P. E., 1978. Linkage map of Salmonella
typhimurium, Microbiol. Rev., 42, 471.
Список штаммов
Все штаммы, кроме обозначенных особо, являются штаммами
Salmonella typhimurium.
Эксперимент 1 NK337 hisC5'27 /еы-414 supE (Р22 c2ts29 72amNll 73amH101
int-3 Tn 10)
LT2
Эксперимент 2 TR 5989 (purВ12)
Пул клонов с транспозициями Тп 10 (10 000)
Р22 (НТ, int~)
Эксперимент 3 ТТ1127 (hisC8667 : : Тп 10, ориентация В)
ТТ1151 (hisC869l : : Тп 10, ориентация А)
ТТ513 (zee-2 : : Тп 10, ориентация А)
Эксперимент 4 ТТ5371 (гек-7Ы : : Тп 10): частота контрансдукции ТпЮ с
hlsW составляет 90%.
Фаг Р22 (НТ, int~), выращенный на ТТ5371 и
мутагенизированный
Клетки LT2
Эксперименты 5 и 6 DB4383 (Е. coli) sup0 gal-l gal-2 SmR lacr- AmpR
DB6430 (E. coli) argEam RifR/NalRA(T"c pro) DB6431 = DB6430 metB- supD
(su 1+, вставляет серии)
DB6432 = DB6430 metB~ supE (su2+, вставляет глутамин)
DB6433 = DB6430 metB~ supF (su3+,
вставляет тирозин, называется также tyrT) DB6434 = DB6430 metB+ supP
(su6+, вставляет лейцин)
DB6435 = DB6430 metB~ supG (sw5+, вставляет лизин)
DB6436 = DB6430 metB- supB (вставляет глутамин)
DB6437 = DB6430 metB~ supC (вставляет тирозин)
Xamp=Kcl857 6515 6519 intam29 Tn2 A,cI1857 6515 6519 ninS intam29 BNN45
(см. эксперимент 8)
A,cII857 ind+
16
Список штаммов
Эксперимент 7
Точковые мутанты his Делеционные мутанты his
ТВ5583 his09857 (his G1102, TR5557 his-9615 (hisG1102,
