Современная генетика. Том 2 - Айала Ф.
ISBN 5-03-000495-5
Скачать (прямая ссылка):
клеток.
Степень разрешения, достигаемая при картировании, определяется
используемыми методами. Наиболее современные методы окрашивания позволяли
выявить до 1000 полос на всех 23 хромосомах человека. В среднем на
хромосому при этом приходится 50 полос, хотя на некоторых хромосомах их
можно обнаружить в несколько раз больше, чем на других (сравни хромосомы
1 и 22 в табл. 18.9). Гаплоидный геном человека состоит из 3 109 п.н.
Каждая полоса содержит 3-106 п.н., что соответствует нескольким сотням
генов. Таким образом, пределом разрешения картирования с привлечением
цитогенетических методов являются расстояния, соответствующие сотням
генов.
Величина генома человека, выраженная в единицах рекомбинации, составляет
3000 сантиморган (сМ), то есть 130 сМ в среднем на хромо-
18. Генетика соматических клеток: картирование генома
317
Таблица 18.7. Типы генетических маркеров, используемые в различных
методах картирования генов человека
Классический семейный анализ
Генетика соматических клеток
Гибридизация in situ и сортировка хромосом
Антигены групп крови (ABO, Rh); гены, связанные с раковыми заболеваниями
(ретинобластома); хромосомные маркеры (деспирали-зованные участки,
делеции); факторы свертываемости крови (фактор XII); клонированные гены
(инсулин); компоненты системы комплемента; маркеры стадий развития
(фетальный гемоглобин); заболевания неизвестной природы (синдром Прадера-
Вилди); полиморфизм ДНК; фрагменты ДНК (неиденти-фицированные); ферменты
(адено-зиндезаминаза, эстераза D); маркеры гистосовместимости (HLA);
метаболические нарушения (фенилке-тонурия); морфологические признаки
(дерматоглифика); митохондриальные маркеры (ядерная глю-
таматоксалацетаттрансаминаза-М); сывороточные белки (альбумин, гапто
глобин); признаки, сцепленные с полом (дальтонизм, дефект по GPD)
Активаторы (активатор плазми-ногена); маркеры культур клеток (промотор
поликароцитози-са, температурочувствительные маркеры, транспортные
мутации); клеточные рецепторы (рецептор эпидермического фактора роста);
белки хромосом (гис-тоны); клонированные гены (НВВ, РОС, GH);
цитоплазматические белки (маркеры двумерного электрофореза); полиморфизм
ДНК; фрагменты ДНК (неидентифицированные); чувствительность к
лекарственным средствам; ферменты (лактатде-гидрогеназа А); маркеры,
влияющие на экспрессию генов; гормоны (PRL, CSH); иммуноглобулины;
мембранные белки (поверхностные антигены); митохондральные маркеры
(ядерная супероксиддисму таза-2); модификаторы (белок, связующийся с
аденозиндезаминазой; маркеры ауксотрофности (ген, ком-плементирующий
отсутствие Ghy); маркеры органелл (лизо-сомные ферменты); рРНК; тРНК;
повторяющиеся последовательности ДНК (DXZ1, сател-литная ДНК); рибосомные
белки; видоспецифичные антигены; структурные белки (коллаген);
чувствительность к токсину (дифтерийный токсин); маркеры, связанные с
вирусами (чувствительность к коронавирусам)
Клонированные гены (GH, INS, НВА); полиморфизм ДНК; фрагменты ДНК
(неидентифицированные) ; рРНК
По Shows Т. В. et al. (1982). Adv. Human Genet., 12, 341-452.
сому. Один сантиморган соответствует приблизительно 106 п.н. (3-109
п.н.;3000 сМ = 106 п.н./сМ). Таким образом, одна полоса, выявленная при
окрашивании хромосом, соответствует 3 сМ.
Генно-инженерные методы обеспечивают значительно более высокое
разрешение. Применяя эти методы, можно картировать последовательности ДНК
протяженностью от нескольких десятков пар нуклеотидов до 100 т.п.н.
(Например, изученный район, содержащий глобиновые гены, имеет размер 60
т.п.н.) Последовательность ДНК в 100 т.п.н. соответствует примерно 0,03
от величины полосы окрашивания или 0,1 сМ. До сих пор не существует
методов, позволяющих заполнить пробел между картированием в пределах 0,1
сМ, осуществляемым генно-инженерными методами, и картированием на
участках величиной от 3 сМ, осуществляемым цитогенетически.
318
Экспрессия генетического материала
DAK Со
GPX1
AF8T
HV1S
OPRT
FN
МАР97
TFRC
TF
СНЕI
СР
SST
RAFJ
RNR
¦ HFE HLA-A
MLRW
HLA-C
HLA-B
IHG
ITG
IPHEG
IGAT
С2
C4F
C4S
С4ВР
NEU1
BF
САН1
C3BR
C3DR
HLA-D/DR
HLA-DC
HLA-SB
IS
PLTI RWS NDF RNTMI . FEA
GCF1
GCTG
ASNS
S7
EGFR
ASL
PSP
GCPS
BLVR
UP
HADH
MDH2
GUSB
COL1A2
COL ЗА I
NHCP1
FG
DIA2
NM
CPA
TRPI
ERBB
GHS
HI
H2A
H2B
H3
LH4
г pi
kH D14S1*
Ligh-
14 ESAT
" PEGS PGFT GL YB
Vh(~250)
6F1
CD CG4 CG2 CG3 CGI CE1 CE2 CA1 L CA2
8
RNR
GANC
BVIN
19
MANB
GPI
PEPD
DNL CB3S PVS El IS M7VS1 BCT2 GVSM HC C3 Le DM NF Se Lu Hh
APOE
FEN
CGB,LHB, FSHB, TSHB
p' jji ¦ Г MEN2 J ITPA
SRC
4 ' ill ¦ SAHH
¦ 3-ADA
20
18. Генетика соматических клеток: картирование генома
319
Рис. 18.20. Генетическая карта человека. Центромера и концы каждой
хромосомы отмечены горизонтальными линиями. Гены хромосомы 1 приведены в
табл. 18.8. (Courtesy of Prof. V.
A. McKusic.)
PKU1
OMR
PFKF
GSAS
MLW
PP
HK1
ADK FS
LIP A
GOT1 FS
DHFR
L'USL
