Химия протеолиза - Антонов В.К.
Скачать (прямая ссылка):
рование и др (204)
4_.9. Заключение .............................................................— 204
ГЛАВА ПЯТАЯ
РЕГУЛЯЦИЯ И ВЛКЛНИЕ ВНЕШНИХ ФАКф0Р0Е
5.1. Зимогены и их активация...................................-.............. 206
5.2. Влияние pH среды ........................................................ 212
5.2.1. Кинетические закономерности (213). 5.2.2. Интерпретация значений констант ионизации (21'5). 5.2.3. Экспериментальные данные (218)
5.3. Влияние ионов и ионной силы раствора ................................. 220
5.3.1. Специфические ионы (221). 5.3.2. Влияние ионной силы раствора (223)
5.4. Влияние органических растворителей.................................... 224
5.5. Кинетический изотопный эффект растворителя ........................... 225
5.6. Влияние температуры и давления........................................ 227
5.6.1. Теория (227). 5.6.2. Экспериментальные данные (229). 5.6.3. Компенсационный эффект (232). 5.6.4. Температурная устойчивость амидгидролаз. Термостабильные ферменты (233)
5.7. Криоэнзимология амидгидролаз ......................................... 235
5.8. Мицеллярная энзимология .............................................. 236
5.9. Ингибиторы ........................................................... 237
5.9.1. Кинетика ингибирования (237). 5.9.2. Неспецифические ингибиторы (240). 5.9.3. Специфические обратимые ингибиторы (243,). 5.9.4. Необратимые группоспецифические ингибиторы (247)- 5.9.5. "Синкаталитические" ингибиторы (252). 5.9.6. Природтые ингибиторы (254). 5.9.7. Ингибиторы -
- "аналоги переходных состотояний" (260)
5.10.Активация ........................................................... 265
5.11.Аллостерические еффекторы ........................................... 266
5.12.Автолиз ..................................................... 267
5.13.Заключение ........................................................... 268
ГЛАВА ШЕСТАЯ
ФЕРМЕНТ-СУБСТРАТНЫЕ КОМПЛЕКСЫ
6.1. Силы взаимодействия .................................................. 270
6.1.1. Дисперсионные взаимодействия (270). 6.1.2. Гидрофобные взаимодействия (271)- 6.1.3. Водородная связь (272). 6.1.4. Электростатические взаимодействия (273). 6.1.5. Друиде тиш* взаимодействий (273)
6.2. Кинетика комплексообразования ........................................ 274
6.2.1. Теория (274). 6.2.2. Экспериментальные данные (275). 6.2.3. Стадийность комплексообразования (275)
6.3. Термодинамика ........................................................ 278
6.4. Конформационные изменения ............................................ 281
6.5. Структура комплексов ................................................. 283
6.5.1. Конформация субстрата в активном центре (285). 6.5.2. Состояние расщепляемой связи (287). 6.5.3. Расположение на ферменте и взаимодействия (288)
6.6. Оценка полной енергии фермент^субстратного взаимодействия ............ 302
6.7. Заключение ........................................................... 302
ГЛАВА СЕДЬМАЯ
ХИМИЧЕСКАЯ ТРАНСФОРМАЦИИ СУБСТРАТА
7.1. Состояние каталитически активных групп................................ 304
7.2. Системы переноса заряда .............................................. 307
7.3. Состояние расщепляемой группы су'Зслуа'па ............................ 311
7.4. Ковалентный или общий основное катализ? .............................. 311
7.5. Электрофил............................................................ 318
7.6. Нуклеофильная атака. Элементарный акт ................................ 319
7.7. Промежуточное тетраедрит’еское соединение ............................ 324
7.8. Перенос протона и распад тетраедрического промежуточного
соединения............................................................. 327
7.9. Ацилфермента и комплексы фермент-продукт ............................ 332
7.10.Механизмы ферментативного гидролиза в сравнительном аспекте ........... 340
7.11.К вопросу об еволюции химических механизмов амидгидролаз ...... 347
7.12.Заключение ............................................................. 347
ГЛАВА ВОСЬМАЯ
СПЕЦИФИЧНОСТЬ И ЭФФЕКТИВНОСТЬ. ТЕОРИИ И ГИПОТЕЗЫ
8.1. Общие сведения ........................................................ 349
8.2. Факторы катализа ...................................................... 351
8.2.1. Сближение и ориентация (351). 8.2.2. Орбитальный контроль (353).
8.2.3. Сольватационные еффекты (354). 8.2.4. Электростатические эффекты (355). 8.2.5. Деформация субстрата (356). 8.2.6. Полифункциональный катализ (357). 8.2.7. Квантово-химические еффекты (357)
8.3. Теории и гипотезы. Дестабилизация основного состояния ................. 358
8.3.1. Непродуктивное связывание (358). 8.3.2. Теория напряжений (362). 8.3.3. Индуцированное соответствие (364)
8.4. Стабилизация переходного состояния .................................... 366