Биофизика познает рак - Акоев И.Г.
Скачать (прямая ссылка):
УЦА - ЦАУ
ГУЦ - ЦГУ
ГАЦ - ЦГА
слот, которых больше в ЛДГ1 и меньше в ЛДГ5 и наоборот. В ЛДГ1 больше
глутамина, треонина, серина, вали-па, аспарагина и фенилаланина. В ЛДГ5,
наоборот, больше гистидина, лизина, аргинина, глицина и изолейцнна.
Предполагали, что увеличение содержания ЛДГ5 идет за счет ошибочных замен
глутамина, треонина, серина, ва-лина, аспарагина и фенилаланина,
характерных для ЛДГ1, на гистидин, лизин, аргинин, глицин, изолейцин,
характерные для ЛДГ5. Возможность таких замен по
98
принципу ошибочного чтения одного нз нуклеотидов кодона или по принципу
сдвига рамки чтения представлена в табл. 5. Анализ показал принципиальную
возможность всех указанных замен аминокислот, если усиление
пролиферативной активности будет сокращать продолжительность
рибосомального цикла.
Сравнивали аминокислотный состав ЛД1\ и ЛДГ5 у человека. Наиболее
заметные отличия: ЛД1\- увеличено содержание аланина, валина,
аспарагиновой кислоты, глутаминовой кислоты и метионина; ЛДГ5- увеличено
содержание аргинина, глицина, тирозина. В случае закономерных переходов
от ЛД1\ к ЛДГ5 должно уменьшаться содержание первых аминокислот и
увеличиваться содержание вторых. Все они могли заменяться по принципу
неправильного чтения одного из нуклеотидов кодона или по сдвигу рамки
чтения (см. табл. 5).
Анализ конкретных замен в аминокислотной последовательности двух изоформ
белка, связанных с изменением пролиферативной активности тканей, провели
на примере сопоставления различий в аминокислотной последовательности
двух изоферментов - ЛД1\ и ЛДГЭ у цыплят и свиней.
В табл. 6 приведены только различия в аминокислотной последовательности
М- и Н-форм ЛДГ у цыплят. Указаны порядковые номера аминокислот в
пептидной цени и избранные триплеты характерных для них кодонов. Из 85
различий в 70 случаях (82%) предполагаемая замена аминокислоты при
переходе от Н4-формы к М4-форме могла нроисходить по принципу изменения
одного нз нуклеотидов триплета (чаще всего по первому нуклеотиду кодона -
61 случай) или по сдвигу рамки чтения (9 случаев). В 12 случаях
необходима замена двух нуклеотидов триплета. Это данные в пользу
возможного объяснения различий между двумя изоформами белка, характерными
для разных состояний пролиферативной активности тканей, механизмами
ошибочного чтения кодонов.
Однако в трех случаях - замена аланина на лизин (ГЦУ и ААА), сернна на
глутамин (УЦУ и ГАА) и гли-цинина на метионин (ГГУ и АУГ) - такое
объяснение не подходит. В этих случаях единственно возможное объяснение
замен связано с генетической регуляцией, с репрессией одних локусов
генома и депрессией других при изменении пролиферативной активности
тканей. Удивляет малый процент таких случаев (3,5%)*
4* 99
Таблица 6. Различия в аминокислотной последовательностиМ- и Н-форм ЛДГ у
цыплят (выписка из работы Торфа п соавторов)
2 5 6 9 10 12 13 14 15 17 18 19
20 24 30 41 43 45
м УЦА ГАУ ЦАУ ЦАЦ ААУ ЦАУ AAA ГАГ ГАА ЦАЦ
ЦАЦ ГЦУ ЦАУ УЦА ГЦГ АУГ ГАУ ГЦУ
Ser Asp His His Asn His Lys Glu Glu His His Ala
His Ser Ala Met Asp Ala
н Thr Glu Lys Thr Pro Ala Ala Gly Ser Thr Val Pro
Ser Thr Gly Gly Gly Cys
АЦА ГГУ ААА АЦЦ ЦЦУ ГЦУ ГЦУ ГГГ УЦУ АЦЦ ГУЦ ЦЦУ
УЦА АЦА ГГ Г ГГУ ГГУ УГЦ
49 54 73 75 78 79 80 84 88 91 93 98
116 123 124 130 132 133
м АДУ ГУУ ААА ЦЦЦ АЦУ УЦА ГГУ УЦА ЦАУ ЦУУ АУУ
ГЦУ АУУ ААЦ ГУУ ГАУ AAA ЦУУ
Thr Val Lys Pro Phr Ser Gly Ser His Leu Не Ala
Не Asn Val Asp Lys Leu
н Ala Leu Glu His Val Ala Asp Ala Asn Не Val Val
Val Gin He Asn Val lie
ГЦУ ЦУУ ЦАА ЦАЦ ГУУ ГЦА ГАУ ГЦА ААУ АУУ ГУУ
ГУУ ГУУ ЦАА АУУ ААУ ГУА АУУ
135 147 150 153 167 172 175 183 190 192 199 212
213 215 217 222 224 226
м АУУ ГЦУ АУУ УУУ УЦУ ЦАУ ГГУ ЦУА ГУУ
ЦАГ ЦЦУ ААГ ГЦА ЦАУ ГАУ ГЦА AAA ЦАУ
Не Ala Не Phe Ser His Gly Leu Val Gin Pro Lys
Ala His Asp Ala Lys His
н Val Thr Leu Leu Thr Tyr Ala Thr Leu Glu Ala Gin
Gin Asp Ala Lys Ser Asn
ГУУ АЦУ ЦУУ УУА АЦУ УАУ ГЦУ АЦУ ЦУУ
ГАГ ГЦУ ЦАГ ЦАГ ГАУ ГЦУ AAA АГУ ААУ
236 243 249 258 260 263 264 268 272 273 276 280
231 284 285 296 297 300
м ГАУ ААА АГУ ГАУ ГЦУ АУА АУГ ЦГУ ЦЦУ АУУ ГЦУ
АУГ ЦАУ AAA ГАУ IT У УЦА АУУ
1VX Asp Lys Ser Asp Ala lie Met Arg Pro Не Ala Met
His Lys Asp Gly Ser lie
и Glu Arg Asn Glu Cys Met Leu Tyr Ser Val Leu Thr
Туг Gin Asn Sar Ala Lou
п ГАА АГА ААУ ГАА УГЦ АУГ ЦУГ УАУ УЦУ ГУУ ЦУГ
АЦГ УАУ ЦАА ААУ АГУ ГЦА ЦУУ
302 304 305 306 307 310 314 315 316 325 329 331
333
ГАУ ГУУ ААА АУГ АУА ЦЦУ ГАА ЦАГ АУУ ГГУ ГАА ЦАА
УУУ
Asp Val Lys Met lie Pro Glu Gin He Gly Glu Gin
Pho
LI Ser Не Asn G In Lys Asp Ala Lys Leu Ser Asp Lys
Leu
д1 АГУ АУУ ААУ ЦАГ AAA ГАУ ГЦА ААГ ЦУУ АГУ ГАУ ААА
УУА
Примечание. Цифры в таблице - номера аминокислот по
i порядку, буквы - сравниваемые нами триплеты
кодонов.
К абсолютному большинству случаев замен аминокислот, как указано выше,
вероятно, применимы закономерности, работающие в простейших модельных
системах во внеклеточных условиях и вне генетической регуляции.
